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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 第一性原理 » Vasp&MedeA » phonopy求助
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pinwei2014銅蟲 (初入文壇)
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[交流]
phonopy求助 已有2人參與
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我建了一個4 5 6的超胞，算完之后得到了vasprun.xml-001，vasprun.xml-002.vasprun.xml-003 結果用phonopy算力常數(shù)的時候出現(xiàn)了如下錯誤： lbg@lbg-Precision-T5610:~/PHONOPY/phonopy-1.8.3/work/Au_456$ phonopy -f vasprun.xml-001 vasprun.xml-002 vasprun.xml-003 _ _ __ | |__ ___ _ __ ___ _ __ _ _ | '_ \| '_ \ / _ \| '_ \ / _ \ | '_ \| | | | | |_) | | | | (_) | | | | (_) || |_) | |_| | | .__/|_| |_|\___/|_| |_|\___(_) .__/ \__, | |_| |_| |___/ 1.8.3 counter (file index): Traceback (most recent call last): File "/usr/local/bin/phonopy", line 437, in <module> is_zero_point=options.force_sets_zero_mode) File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/phonopy/file_IO.py", line 190, in write_FORCE_SETS_vasp etree.iterparse(force_files, tag='varray')) File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/phonopy/interface/vasp.py", line 95, in get_forces_vasprun_xml for event, element in vasprun: File "iterparse.pxi", line 478, in lxml.etree.iterparse.__next__ (src/lxml/lxml.etree.c:98432) File "iterparse.pxi", line 530, in lxml.etree.iterparse._read_more_events (src/lxml/lxml.etree.c:98953) File "parser.pxi", line 590, in lxml.etree._raiseParseError (src/lxml/lxml.etree.c:74696) lxml.etree.XMLSyntaxError: Extra content at the end of the document, line 3687, column 15 求指點 |
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