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[求助] phonopy BORN file 已有2人參與

請問這個(gè)BORN file 要怎么寫？這個(gè)校正可以校正什么？

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1樓 2014-03-13 13:46:15

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kwanqsh

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【答案】應(yīng)助回帖

★
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2014-04-13 12:26:04

This is the content of BORN:
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-2.17866  0.0 0.0 0.0 -5.90230 0.0    0.0 0.0 -2.17863
-5.90211  0.0 0.0 0.0 -2.17886 0.0    0.0 0.0 -2.17863
The first line is the unit conversion factor. For vasp,it is 27.2116*0.52918=14.399834488
第二排就是才OUTCAR里的MACROSCOPIC STATIC DIELECTRIC TENSOR （including tensor。。。
后面是BORN EFFECTIVE CHARGE
。。。
請問您知道這個(gè)文件要怎么用嗎我試了好幾次算分裂的都不對

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2樓2014-03-29 11:24:46

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劉仕晨

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【答案】應(yīng)助回帖

★
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2014-04-13 12:26:40

手冊里面有寫，這個(gè)文件都寫的很清楚，不過如果實(shí)在不清楚，告訴你一個(gè)簡單的方法，phonopy的作者已經(jīng)寫好了獲取這個(gè)文件的腳步，你直接運(yùn)行就可以，不知道你安裝在哪里，如果已經(jīng)加入環(huán)境變量，直接敲入outcar-born命令就可以，或者去你的安裝目錄找。
主要用于修正LO-TO spliting。

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3樓2014-03-29 18:35:08

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引用回帖:

3樓: Originally posted by 劉仕晨 at 2014-03-29 18:35:08
手冊里面有寫，這個(gè)文件都寫的很清楚，不過如果實(shí)在不清楚，告訴你一個(gè)簡單的方法，phonopy的作者已經(jīng)寫好了獲取這個(gè)文件的腳步，你直接運(yùn)行就可以，不知道你安裝在哪里，如果已經(jīng)加入環(huán)境變量，直接敲入outcar-bor ...

請問有了這個(gè)文件和band以后是直接phonopy --nac運(yùn)行嗎我這樣運(yùn)行出來的沒有分裂

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4樓2014-03-30 15:16:18

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4樓: Originally posted by kwanqsh at 2014-03-30 15:16:18
請問有了這個(gè)文件和band以后是直接phonopy --nac運(yùn)行嗎我這樣運(yùn)行出來的沒有分裂...

命令是phonopy -p --nac band.conf，除非你不是極性晶體，不然如果計(jì)算都正確的話，應(yīng)該沒有問題的

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5樓2014-03-30 18:19:04

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感覺outcar-born文件是不太合適的，會(huì)報(bào)錯(cuò)
Traceback (most recent call last):
File "/usr/local/bin/outcar-born", line 105, in <module>
symmetrize_tensors=options.symmetrize_tensors)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/phonopy/interface/vasp.py", line 219, in get_born_OUTCAR
for x in outcar.readline().split()][1:])
ValueError: could not convert string to float: Berry
手動(dòng)寫了一個(gè)born文件搞定了，可是這樣太麻煩，有改進(jìn)的方法么？
好像vasp.py中born有效電荷查找的位置不太對，
查到了Berry附近去了。。

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6樓2014-04-11 14:14:09

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4樓: Originally posted by kwanqsh at 2014-03-30 15:16:18
請問有了這個(gè)文件和band以后是直接phonopy --nac運(yùn)行嗎我這樣運(yùn)行出來的沒有分裂...

請問你的outcar-born能夠正常運(yùn)行么？我的會(huì)出樓上的錯(cuò)誤。。。

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7樓2014-04-11 15:21:51

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7樓: Originally posted by 傷心春草 at 2014-04-11 15:21:51
請問你的outcar-born能夠正常運(yùn)行么？我的會(huì)出樓上的錯(cuò)誤。。。...

我之前也是手寫的，后來才發(fā)現(xiàn)這個(gè)腳本的，沒有問題，可以正常獲取

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8樓2014-04-11 17:27:24

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7樓: Originally posted by 傷心春草 at 2014-04-11 15:21:51
請問你的outcar-born能夠正常運(yùn)行么？我的會(huì)出樓上的錯(cuò)誤。。。...

我是手動(dòng)寫的這個(gè)outcar-born出現(xiàn)和你的錯(cuò)誤一樣。。。

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9樓2014-04-13 20:31:35

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7樓: Originally posted by 傷心春草 at 2014-04-11 15:21:51
請問你的outcar-born能夠正常運(yùn)行么？我的會(huì)出樓上的錯(cuò)誤。。。...

是不是vasp版本的問題啊，你們用的是那個(gè)版本的vasp啊，我之前獲取正常只有在5.2.2時(shí)候用過，5.2.12和5.3都沒有測試過。

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10樓2014-04-14 00:41:01

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