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Gaussian03操作與實(shí)例(一)
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一、MP2/6-31G*水平下CH4結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率分析 %chk=OPT-FREQ-CH4.chk %mem=6MW %nproc=1 # opt freq mp2/6-31+g TEST OPT And FREQ on CH4 0 1 C H 1 B H 1 B 2 A H 1 B 3 A 2 -120.0 H 1 B 3 A 2 120.0 Variables B 1.07 Constants A 109.47120255 用GaussView打開(kāi)文件,提示 圖一 搜索了一下高斯用戶(hù)手冊(cè),發(fā)現(xiàn)在Variables和Constants丟了冒號(hào)(英文半角),如果沒(méi)有冒號(hào),GaussView認(rèn)為它們是元素符號(hào),沒(méi)有這種元素,導(dǎo)致出錯(cuò)。 提示:直接用G03打開(kāi)文件,有沒(méi)有冒號(hào)都可以正常打開(kāi)和運(yùn)行。 二、丙烯單點(diǎn)能計(jì)算——電荷分析 C:\G03W\exercise\2_01.gjf Propene Single Point #T RHF/6-31G(d) 運(yùn)行結(jié)果如下: Mulliken atomic charges: 1 1 C -0.388759 2 C -0.156384 3 C -0.507949 4 H 0.170153 5 H 0.173467 6 H 0.184153 7 H 0.165601 8 H 0.179859 9 H 0.179859 Sum of Mulliken charges= 0.00000 圖二 3號(hào)C原子的電荷<1號(hào)<2號(hào),原因是它們連接的H原子依次減少,H原子提供給C原子的電荷依次減少;H原子都帶少量的正電荷,整個(gè)分子呈電中性。 三、用GView提交G03作業(yè) 如果你不熟悉寫(xiě)G03的輸入文件,不妨讓GView來(lái)幫忙。使用GView建立好分子結(jié)構(gòu)后,點(diǎn)菜單欄的“Calcluate”-“Gaussian”即可進(jìn)入“Gaussian Calclution Setup”界面。 圖三 圖四 高斯計(jì)算設(shè)置界面的“Jop Type”選項(xiàng)可以設(shè)置計(jì)算類(lèi)型,“Method”可以設(shè)置計(jì)算方法、基組、電荷與自旋多重度,“Title”可以為計(jì)算命名等。 設(shè)置完畢后點(diǎn)“Submit”可以提交作業(yè),如果你更改了設(shè)置,系統(tǒng)會(huì)提示你先保存.gjf文件,然后詢(xún)問(wèn)你是否提交該文件給高斯進(jìn)行計(jì)算,點(diǎn)“OK”確認(rèn),高斯軟件就開(kāi)始運(yùn)行了。 圖五 四、用GView把優(yōu)化結(jié)果轉(zhuǎn)化為輸入文件 對(duì)一個(gè)分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化后,再提交給G03進(jìn)行其它計(jì)算時(shí),需要把.out或.log格式的結(jié)果文件再轉(zhuǎn)化為輸入文件。在GView中打開(kāi)結(jié)果文件,點(diǎn)菜單的“File”-“Save”,保存文件時(shí)選擇文件類(lèi)型為"Gaussian Input File(*.gif *.com)"就可以把文件存為輸入文件了。 [ Last edited by mingdong on 2009-6-13 at 22:09 ] |
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