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addict_cy金蟲 (小有名氣)
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推薦RhesusBase:一個(gè)整合1667套人、猴NGS數(shù)據(jù)的在線資源
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如果你想根據(jù)RNA-Seq數(shù)據(jù)，研究一個(gè)基因在人、猴多組織中的表達(dá)，剪切和調(diào)控, 如果你想直觀地在Genome Browser中看人、猴NGS數(shù)據(jù)的原始reads信息, 如果你想在一個(gè)整合有ChIP-Seq, poly(A)-Seq, CLIP-Seq等豐富注釋信息的基因組框架下，研究一個(gè)基因的調(diào)控; 當(dāng)你發(fā)現(xiàn)不同的RNA-Seq數(shù)據(jù)得到不同結(jié)論，糾結(jié)于哪一套數(shù)據(jù)更可靠、是否有規(guī)范化的NGS數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)分規(guī)則時(shí), 當(dāng)你發(fā)現(xiàn)一個(gè)基因及其調(diào)控模式在人-鼠之間存在巨大差異，想進(jìn)一步了解在恒河猴中對(duì)應(yīng)的情況時(shí), 當(dāng)你發(fā)現(xiàn)恒河猴的基因結(jié)構(gòu)注釋存在大量錯(cuò)誤，沒(méi)法開(kāi)展分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)研究時(shí), 請(qǐng)關(guān)注我們開(kāi)發(fā)的恒河猴基因組知識(shí)庫(kù)“RhesusBase“: http://www.rhesusbase.org/ 相關(guān)文獻(xiàn)（如果RhesusBase的數(shù)據(jù)和分析流程對(duì)您的研究有幫助，請(qǐng)引用相應(yīng)的論文，謝謝）： For RhesusBase Gene Page, Genome Browser and Molecular Evolution Gateway: 1. Evolutionary Interrogation of Human Biology in Well-annotated Genomic Framework of Rhesus Macaque. Molecular Biology and Evolution, 2014. http://mbe.oxfordjournals.org/co ... 03/17/molbev.msu084 2. RhesusBase: a Knowledgebase for the Monkey Research Community. Nucleic Acids Research, 2013. http://nar.oxfordjournals.org/content/41/D1/D892.full For Original NGS Datasets in RhesusBase: - For strand-specific RNA-Seq data in multiple tissues of the same animal, please cite: 3. Hominoid-specific De Novo Protein-coding Genes Originating from Long Non-coding RNAs. PLoS Genetics, 2012 http://www.plosgenetics.org/arti ... ournal.pgen.1002942 - For strand specific RNA-Seq data from multiple tissues, as well as the whole genome sequencing data (60x) of the same animal, please cite: 4. RNA Editome in Rhesus Macaque Shaped by Purifying Selection. PLoS Genetics, 2014, doi:10.1371/ journal.pgen.1004274. in press |
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addict_cy
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2樓2014-03-21 11:04:56
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