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rt，圖1是溫度隨時(shí)間變化曲線(xiàn)，圖中溫度波動(dòng)比較厲害，我想問(wèn)這正常么？如何降低溫度的波動(dòng)幅度呢？縮小time step？還是要修改Nose里面的那個(gè)參數(shù)Q？圖2是我的一些設(shè)置參數(shù)，圖3是最終得到的結(jié)果（請(qǐng)問(wèn)我想知道體系最終的勢(shì)能，應(yīng)該時(shí)選擇final呢還是average呢？）謝謝各位大牛了

請(qǐng)各位蟲(chóng)友幫忙看看這樣的結(jié)果有沒(méi)有收斂

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請(qǐng)各位蟲(chóng)友幫忙看看這樣的結(jié)果有沒(méi)有收斂-1

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1樓 2014-03-23 10:15:25

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zhuhy1116

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你這是用MS算的？什么模塊？

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2樓2014-03-23 21:25:09

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tawfischer

木蟲(chóng) (小有名氣)

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月只藍(lán): 金幣+1, 鼓勵(lì)交流！ 2014-03-24 19:10:25

建議把時(shí)間拉長(zhǎng)一些，前面一段是找平衡的，體系在不斷的優(yōu)化中，取后面階段的平均值是可以的。

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3樓2014-03-23 22:02:13

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huachao90

禁蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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4樓2014-03-24 00:39:07

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skywyy2011

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2樓: Originally posted by zhuhy1116 at 2014-03-23 21:25:09
你這是用MS算的？什么模塊？

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5樓2014-03-24 11:01:26

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3樓: Originally posted by tawfischer at 2014-03-23 22:02:13
建議把時(shí)間拉長(zhǎng)一些，前面一段是找平衡的，體系在不斷的優(yōu)化中，取后面階段的平均值是可以的。

嗯，好的，那在計(jì)算平均值的時(shí)候程序會(huì)也將一開(kāi)始時(shí)間內(nèi)的數(shù)據(jù)也考慮進(jìn)去么？因?yàn)橐婚_(kāi)始的數(shù)據(jù)波動(dòng)比較大，如果考慮進(jìn)去的話(huà)是不是會(huì)引入誤差？

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6樓2014-03-24 11:06:24

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4樓: Originally posted by huachao90 at 2014-03-24 00:39:07
你結(jié)束，然后選擇繼續(xù)跑restart就能看到溫度和能量波動(dòng)大小更顯著了

繼續(xù)跑就能看到波動(dòng)更顯著？可是波動(dòng)越大不是說(shuō)明體系越不平衡么？那這是不是意味著我算錯(cuò)了？

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7樓2014-03-24 11:08:27

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huachao90

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8樓2014-03-25 01:14:52

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8樓: Originally posted by huachao90 at 2014-03-25 01:14:52
restart確實(shí)能看出來(lái)溫度到底平衡與否的，首先建議你看看文獻(xiàn)溫度波動(dòng)在什么范圍內(nèi)的有的說(shuō)5k 還有你的是平衡體系還是費(fèi)平衡體系的，平衡體系與你的初始條件無(wú)關(guān)的，但是非平衡是有關(guān)的
...

如何判斷是否是平衡體系？我的是建好模型后直接優(yōu)化，然后再跑的動(dòng)力學(xué)

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9樓2014-03-25 12:04:46

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10樓2014-03-25 13:28:00

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