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[求助]
【求助】用chemdraw計算DNA的molecular dynamics的結果顯示堿基都在外端合理嗎？
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如題，小蟲我最近嘗試用chemdraw計算DNA的molecular dynamics，結果顯示堿基都在外端，而磷酸骨架都在內部，這樣的結果合理嗎？ 由于小蟲我不是做計算的，不懂這些東西，都是軟件自動算的，只知道把溫度確定為300K, step=2.0fs, frame=10 ,terminate afte=10000 step, heating/cooling rate=1.0 cal/atom/p. 另外，DNA的序列為5‘-CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCC-3'. 請高手看看這個結果是不是合理，具體的計算結構如附件所示。 還請懂行的前輩們幫幫忙，不勝感激！ CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCC-dynamics.jpg |
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