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xja1830木蟲 (正式寫手)
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[求助]
求解單晶牛人幫看一個(gè)結(jié)構(gòu) 已有1人參與
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| 已經(jīng)請(qǐng)xi2004老師幫忙好幾次了，這次不好意思再請(qǐng)他幫忙了。本人新手，也在不斷學(xué)習(xí)中。最近組里做一個(gè)單晶，我給解出來(lái)了，只是goof值和r值比較大，checkcif提示有溶劑分子沒(méi)有解析出來(lái)。同學(xué)說(shuō)只用了二氯甲烷和正己烷重結(jié)晶，我精修時(shí)看到一些Q峰連接，但是從鍵長(zhǎng)和鍵角看不像DCM，有可能是其他溶劑分子。或者我想是不是我把結(jié)構(gòu)解錯(cuò)了？請(qǐng)個(gè)高手給看看！結(jié)構(gòu)、hkl、p4p文件和我解析過(guò)程在附件里。解完麻煩連同ins文件、cif和checkcif文件發(fā)至xiao1830@126.com,無(wú)A、B類錯(cuò)誤即返金幣。 |
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2014-03-31 21:57:47, 763.66 K
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| 不會(huì)弄 啊，貌似是正己烷在對(duì)稱元素上，定不好，所以用squeeze干掉了，懶人的做法。已發(fā)郵箱。 |
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2014-04-01 05:01:22, 148.8 K
2樓2014-04-01 05:01:29
xja1830
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您好！這個(gè)溶劑無(wú)序也只能squeeze處理了。先謝謝你了。不過(guò)我要問(wèn)下，我squeeze后有兩套新數(shù)據(jù)包含hkl和ins，res文件，無(wú)hkb文件，分別以sq和sqd后綴結(jié)尾。我將name_sq.hkl改成精修后含溶劑峰的衍射數(shù)據(jù)文件name_hkl并替換這個(gè)文件,再XL，但是還是不能收斂，goof很大，我又試著用 name_sqd.hkl改成name_hkl并替換這個(gè)文件,再XL ，發(fā)現(xiàn)經(jīng)過(guò)幾輪后收斂了，checkcif之后，只有一個(gè)B級(jí)錯(cuò)誤提示還含有溶劑沒(méi)解析出來(lái)。沒(méi)有A級(jí)錯(cuò)誤。為什么您解析時(shí)沒(méi)有出現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題？麻煩您了！望提點(diǎn)下。 |
3樓2014-04-01 16:13:24
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用olex2的solvent mask除掉溶劑了，只剩下一個(gè)B類錯(cuò)誤 PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of . 156 Ang3 這個(gè)據(jù)說(shuō)解釋一下就行了。 |
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4樓2014-04-15 21:34:38
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