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新蟲 (小有名氣)

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蟲號(hào): 1808401
注冊(cè): 2012-05-10
性別: GG
專業(yè): 有機(jī)合成

[求助] 新手求助，輸入文件出錯(cuò)，麻煩看下已有2人參與

gaus新手剛接觸學(xué)習(xí)了，在實(shí)際操作結(jié)構(gòu)優(yōu)化時(shí)有兩個(gè)問題請(qǐng)教：
1，想做結(jié)構(gòu)優(yōu)化，看看取代基對(duì)分子構(gòu)型的影響，這樣可以嗎？是直接OPT+FREQ還是先算能量最低再優(yōu)化？
2，輸入文件出錯(cuò)（輸入文件是在view里構(gòu)型然后Cal選擇輸入信息的），出錯(cuò)信息是：severe error message #2070  The processing of the last link ended abnormally. All processing has been aborted.
下面是輸入文件內(nèi)容，請(qǐng)大家指正下，謝謝�。�！

%chk=C:\Users\lenovo\Desktop\pdic12br.chk
%mem=500MB
#p b3lyp/3-21g** opt freq=norama

pdic12br

0 1
C                -7.55839842 -5.96516455 -1.84073548
C                -5.45055842 -4.73291355 -1.84073548
C                -6.18698542 -3.50813255 -1.84055948
C                -7.59543342 -3.53314455 -1.84067248
C                -8.26381342 -4.79196955 -1.84073248
C                -4.02166642 -4.70753955 -1.84068748
C                -5.49450842 -2.25799055 -1.84019148
C                -4.06561142 -2.23260555 -1.83979748
C                -3.32919042 -3.45738455 -1.84008748
C                -6.22040142 -1.05074355 -1.83998048
C                -7.64476442 -1.10132655 -1.84029048
C                -8.30807842 -2.29883955 -1.84059648
H                -8.20090142 -0.15138955 -1.84022148
H                -8.08046542 -6.93424555 -1.84074148
C                -3.29578642 -5.91477755 -1.84111348
C                -1.87142042 -5.86419155 -1.84108048
C                -1.20810542 -4.66667955 -1.84023648
C                -1.92075342 -3.43238155 -1.83967948
H                -1.31528842 -6.81412255 -1.84157748
C                -1.95779942 -1.00034455 -1.83826348
H                -1.43573542 -0.03124355 -1.83725648
C                -1.25237642 -2.17354455 -1.83867148
C                -9.80378528 -4.80127875 -1.84072968
O             -10.30145913 -6.14188334 -1.84098907
O             -10.39236151 -1.02211533 -1.83802613
C                -9.84741008 -2.34420466 -1.84080774
Br             -4.16482387 -7.42002354 -1.84129031
Br             -5.35137278 0.45450740 -1.83932683
C                0.33122605 -4.62130881 -1.83988672
C                0.28759507 -2.16419481 -1.83804611
O                1.01260134 -5.72996076 -1.84039622
O                0.92914974 -1.03203385 -1.83712327
N                1.05891287 -3.26407965 -1.83893521
C                1.57399399 -3.62838252 -1.12514957
C                3.08071199 -3.62837254 -1.12514612
H                1.17948717 -4.27980764 -1.94217740
H                1.17955930 -4.01044578 -0.15251671
C                3.63831174 -5.02052858 -0.91553627
H                3.45790550 -3.21869896 -2.09936400
H                3.45429873 -2.96749974 -0.29876978
H                3.26113722 -5.43019099 0.05866172
H                3.26107908 -5.69885670 -1.72592104
C                5.17831173 -5.02049996 -0.91560271
C                5.70267828 -6.43302920 -0.91566771
H                5.53101462 -4.46878988 -0.01075937
H                5.53083807 -4.46885534 -1.82057737
C                7.21657322 -6.46580482 -0.91591200
H                5.31833417 -6.97809461 -0.01323148
H                5.33523947 -6.96789417 -1.83115991
C                7.74091909 -7.87835880 -0.91591200
H                7.60091082 -5.92076208 -1.81833023
H                7.38823054 -8.42993137 -0.01095733
H                7.38790750 -8.43005335 -1.82066633
C                9.28091904 -7.87862368 -0.91618393
C                9.80501907 -9.29117083 -0.90105663
H                9.63384842 -7.31723619 -0.01740156
H                9.63342701 -7.33685638 -1.82711316
C                11.31890776 -9.32423498 -0.90114849
H                9.42069423 -9.82638068 0.00726747
H                9.43735552 -9.83582644 -1.81066729
C                11.84298712  -10.73680617 -0.88595592
H                11.70322609 -8.78904761 -1.80945434
H                11.70371427 -8.76947247 -0.00486756
H                11.49031694  -11.27850160 0.02495257
H                11.48974905  -11.29817710 -1.78464941
C                13.38298694  -10.73736673 -0.88643016
H                13.74010764  -10.22362319 -0.01842533
H                13.73928944  -11.74624264 -0.87557010
H                13.73956318  -10.24262384 -1.76562459
N             -10.73953351 -3.42495964 -1.84334104
C             -11.62808949 -3.62330649 -2.99747569
C             -13.07025626 -3.53571554 -2.57006257
H             -11.40886977 -4.62355110 -3.44354545
H             -11.39468488 -2.84176945 -3.76055359
C             -14.01147458 -3.73613263 -3.73920467
H             -13.27916711 -4.31119639 -1.78635755
H             -13.26706677 -2.52488612 -2.12429662
C             -15.45364907 -3.64860011 -3.31174923
H             -13.80257801 -2.96066608 -4.52288795
H             -13.81675543 -4.73741247 -4.20683712
H             -15.68689808 -4.43010365 -2.54859028
H             -15.67267051 -2.64840321 -2.86543073
C             -16.38474941 -3.85615684 -4.52070430
C             -17.82684299 -3.76982145 -4.09278909
H             -16.16500435 -4.85594182 -4.96754532
H             -16.15209545 -3.07392843 -5.28330287
C             -18.76828613 -3.97003831 -5.26178448
H             -18.03500089 -4.54599198 -3.30956662
H             -18.02418594 -2.75943661 -3.64625127
C             -20.21038738 -3.88376138 -4.83382698
H             -18.56014249 -3.19388210 -6.04498521
H             -18.57304754 -4.97085956 -5.73018143
H             -20.44288573 -4.66595625 -4.07114738
H             -20.42993405 -2.88402415 -4.38673732
C             -21.14171998 -4.09108315 -6.04264345
C             -22.58373699 -4.00564156 -5.61429100
H             -20.92163864 -5.09052305 -6.49009053
H             -20.90963034 -3.30833158 -6.80487708
C             -23.52540494 -4.20565005 -6.78314098
H             -22.79132777 -4.78233532 -4.83143679
H             -22.78142116 -2.99559140 -5.16714738
C             -24.96742957 -4.12026694 -6.35474627
H             -23.31782841 -3.42897063 -7.56597346
H             -23.32983542 -5.20612564 -7.25213793
H             -25.64291618 -4.27042770 -7.23116996
H             -25.19936360 -4.90298494 -5.59243164
H             -25.18731244 -3.12087484 -5.90705063
H                7.58329133 -5.94600660 -0.05554717
C                -6.13313642 -5.96516455 -1.84073548
H                -5.52792830 -6.84756079 -1.84085735
C                -3.38306142 -1.00034955 -1.83905648
H                -3.98828433 -0.11796345 -1.83914707

1 5 2.0 14 1.0 109 1.0
2 3 1.0 6 1.0 109 2.0
3 4 2.0 7 1.0
4 5 1.0 12 1.0
5 23 1.0
6 9 1.0 15 2.0
7 8 1.0 10 2.0
8 9 1.0 111 2.0
9 18 2.0
10 11 1.0 28 1.0
11 12 2.0 13 1.0
12 26 1.0
13
14
15 16 1.0 27 1.0
16 17 2.0 19 1.0
17 18 1.0 29 1.0
18 22 1.0
19
20 21 1.0 22 2.0 111 1.0
21
22 30 1.0
23 24 2.0 70 1.0
24
25 26 2.0
26 70 1.0
27
28
29 31 2.0 33 1.0
30 32 2.0 33 1.0
31
32
33 34 1.0
34 35 1.0 36 1.0 37 1.0
35 38 1.0 39 1.0 40 1.0
36
37
38 41 1.0 42 1.0 43 1.0
39
40
41
42
43 44 1.0 45 1.0 46 1.0
44 47 1.0 48 1.0 49 1.0
45
46
47 50 1.0 51 1.0 108 1.0
48
49
50 52 1.0 53 1.0 54 1.0
51
52
53
54 55 1.0 56 1.0 57 1.0
55 58 1.0 59 1.0 60 1.0
56
57
58 61 1.0 62 1.0 63 1.0
59
60
61 64 1.0 65 1.0 66 1.0
62
63
64
65
66 67 1.0 68 1.0 69 1.0
67
68
69
70 71 1.0
71 72 1.0 73 1.0 74 1.0
72 75 1.0 76 1.0 77 1.0
73
74
75 78 1.0 79 1.0 80 1.0
76
77
78 81 1.0 82 1.0 83 1.0
79
80
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83 84 1.0 85 1.0 86 1.0
84 87 1.0 88 1.0 89 1.0
85
86
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88
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91
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93
94
95 96 1.0 97 1.0 98 1.0
96 99 1.0 100 1.0 101 1.0
97
98
99 102 1.0 103 1.0 104 1.0
100
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1樓 2014-04-01 12:11:50

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+3 2014-04-01 15:21:34
262413748: 金幣+5, ★★★很有幫助, 辛苦了，謝謝，我再學(xué)習(xí)下如何計(jì)算出來結(jié)果，也就是循環(huán)問題 2014-04-02 20:32:37

1、opt+freq就是先優(yōu)化再頻率；
2、去拉曼關(guān)鍵詞拼錯(cuò)，去看高斯手冊(cè)。
還是那句話，新手學(xué)習(xí)先從看高斯手冊(cè)開始。

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2樓2014-04-01 12:38:17

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lxying

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

norama錯(cuò)誤，其實(shí)輸出out文件最后部分一般會(huì)給出錯(cuò)誤的地方。程序使用過程中不能運(yùn)行的情況很多，自己找到原因，結(jié)合使用說明，力爭(zhēng)自己解決。

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明天會(huì)更好！

3樓2014-04-01 15:55:25

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2樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2014-04-01 12:38:17
1、opt+freq就是先優(yōu)化再頻率；
2、去拉曼關(guān)鍵詞拼錯(cuò)，去看高斯手冊(cè)。
還是那句話，新手學(xué)習(xí)先從看高斯手冊(cè)開始。

謝謝！
我后來調(diào)試成#p opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity可以運(yùn)行，也如您所說拼錯(cuò)了

還有個(gè)問題想問您一下，其他都一樣，但是計(jì)算了一下午了一直在SCF到301等等計(jì)算，最后又回到了SCF，這樣循環(huán)，是沒有計(jì)算到合適的嗎？

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4樓2014-04-01 16:48:42

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3樓: Originally posted by lxying at 2014-04-01 15:55:25
norama錯(cuò)誤，其實(shí)輸出out文件最后部分一般會(huì)給出錯(cuò)誤的地方。程序使用過程中不能運(yùn)行的情況很多，自己找到原因，結(jié)合使用說明，力爭(zhēng)自己解決。

恩，這種基礎(chǔ)錯(cuò)誤不應(yīng)該犯的。同樣想問您一下，#p opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity 計(jì)算，一直在SCF和后續(xù)幾個(gè)程序如L301 302等循環(huán)，是計(jì)算不到合適的嗎？有什么方法可以去尋找解決辦法？望指點(diǎn)

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5樓2014-04-01 16:50:34

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這分子還真不小。內(nèi)存500Mb夠用嗎。view里給出的一般都有g(shù)eom=connectivity。降低收斂標(biāo)準(zhǔn)可以減少scf循環(huán)次數(shù)，當(dāng)然也有可能就不收斂。

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6樓2014-04-01 17:10:09

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6樓: Originally posted by oyezzy at 2014-04-01 17:10:09
這分子還真不小。內(nèi)存500Mb夠用嗎。view里給出的一般都有g(shù)eom=connectivity。降低收斂標(biāo)準(zhǔn)可以減少scf循環(huán)次數(shù)，當(dāng)然也有可能就不收斂。

謝謝�。�！怎么判斷大概需要多大內(nèi)存？確實(shí)分子不小，我現(xiàn)在中止了在看OUT文件，希望能找到錯(cuò)誤所在。不收斂的話gaus應(yīng)該會(huì)有個(gè)自動(dòng)結(jié)束的方法吧？

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7樓2014-04-01 17:51:45

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4樓: Originally posted by 262413748 at 2014-04-01 16:48:42
謝謝！
我后來調(diào)試成#p opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity可以運(yùn)行，也如您所說拼錯(cuò)了

還有個(gè)問題想問您一下，其他都一樣，但是計(jì)算了一下午了一直在SCF到301等等計(jì)算，最后又回到了SCF，這樣循環(huán)， ...

這就是計(jì)算的方法，一直跑循環(huán)和迭代直到到達(dá)收斂標(biāo)準(zhǔn)。如果最后沒有收斂，程序會(huì)報(bào)錯(cuò)，輸出文件最后也會(huì)寫。至于你說的需要多少內(nèi)存，在你不確定的情況下盡量大一點(diǎn)，可以去參考下高斯手冊(cè)中“估計(jì)計(jì)算的內(nèi)存需求”這章

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8樓2014-04-02 07:01:51

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7樓: Originally posted by 262413748 at 2014-04-01 17:51:45
謝謝！！！怎么判斷大概需要多大內(nèi)存？確實(shí)分子不小，我現(xiàn)在中止了在看OUT文件，希望能找到錯(cuò)誤所在。不收斂的話gaus應(yīng)該會(huì)有個(gè)自動(dòng)結(jié)束的方法吧？...

在達(dá)到最大循環(huán)次數(shù)（可以自己設(shè)定Maxcycle=60,120...等等）仍不收斂的時(shí)候就會(huì)結(jié)束。

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9樓2014-04-02 09:15:36

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8樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2014-04-02 07:01:51
這就是計(jì)算的方法，一直跑循環(huán)和迭代直到到達(dá)收斂標(biāo)準(zhǔn)。如果最后沒有收斂，程序會(huì)報(bào)錯(cuò)，輸出文件最后也會(huì)寫。至于你說的需要多少內(nèi)存，在你不確定的情況下盡量大一點(diǎn)，可以去參考下高斯手冊(cè)中“估計(jì)計(jì)算的內(nèi)存需求 ...

恩好的謝謝！我去看看今天算了一天還是沒算到頭= =

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10樓2014-04-02 20:11:25

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