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silence0919

新蟲 (小有名氣)

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[求助] 拉曼圖譜已有1人參與

求教：
有人幫忙做了一個蛋白的分子模擬。想知道拉曼圖是個什么東西？有沒有哪里可以查到的？用來評價分子模擬構(gòu)型的合理性的嗎？
模擬構(gòu)型的合理性標(biāo)準(zhǔn)是什么？

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1樓 2014-04-01 20:15:33

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

xulinan

木蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
月只藍(lán): 金幣+3, 鼓勵交流！ 2014-04-02 16:38:44
silence0919: 金幣+3, ★★★很有幫助, 感謝 2014-04-07 15:46:12

拉式構(gòu)象圖反應(yīng)的是蛋白構(gòu)象的合理性，你百度一下就可以看到標(biāo)準(zhǔn)的拉氏構(gòu)象圖的區(qū)間分布。簡單的來說圖中顯示了氨基酸落在合理區(qū)域的情況。通常有90%的氨基酸分布在合理區(qū)域我們就認(rèn)為這個構(gòu)象比較合理。但是這個也不是唯一標(biāo)準(zhǔn)，我曾經(jīng)測過晶體結(jié)構(gòu)的拉氏構(gòu)象分布，發(fā)現(xiàn)有的只有70、80%，自己構(gòu)建了一個同源的到是90%。但是你顯然不能說我自己構(gòu)建的這個比人家晶體結(jié)構(gòu)還合理。所以，你可以用它了作為一個判斷標(biāo)準(zhǔn)，但不唯一。

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回復(fù)此樓

2樓2014-04-01 21:55:28

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