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ddwy木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
量化計(jì)算結(jié)果 已有1人參與
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我做氨基酸結(jié)構(gòu)優(yōu)化，關(guān)鍵詞設(shè)置為： #P cam-b3lyp/aug-cc-pvdz Maxdisk=20GB opt=(Z-matrix, maxcycle=200) freq=raman scf=(direct, tight) scfcyc=300 nosymm 出現(xiàn)這樣的錯(cuò)誤： Error termination via Lnk1e in /public/software/g09/l716.exe at Thu Apr 3 18:36:56 2014. 請(qǐng)問(wèn)，有誰(shuí)知道這樣的錯(cuò)誤怎么改正嗎？ |
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ddwy
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你好，我重新凍結(jié)了所有分子的分子內(nèi)鍵長(zhǎng)，還是用內(nèi)坐標(biāo)，同樣的設(shè)置關(guān)鍵詞，但是結(jié)果還是出錯(cuò) Cartesian Forces: Max 0.143807193 RMS 0.033409470 Error on Z-matrix card number 17 angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180. Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed: --------------------------------------------------------------------------------------------------- Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J --------------------------------------------------------------------------------------------------- 1 1 N 2 2 H 1 0.999900( 1) 3 3 H 1 0.999900( 2) 2 108.084( 26) 4 4 H 1 1.000000( 3) 2 104.961( 27) 3 236.884( 50) 0 5 5 C 1 1.469900( 4) 2 100.157( 28) 3 120.151( 51) 0 6 6 H 5 1.069900( 5) 1 108.454( 29) 3 262.084( 52) 0 7 7 C 5 1.540000( 6) 1 111.062( 30) 3 387.079( 53) 0 8 8 H 7 1.069900( 7) 5 110.961( 31) 6 57.514( 54) 0 9 9 H 7 1.070000( 8) 5 110.775( 32) 6 179.754( 55) 0 10 10 H 7 1.069900( 9) 5 107.936( 33) 6 298.455( 56) 0 11 11 C 5 1.539900( 10) 1 100.120( 34) 3 149.834( 57) 0 12 12 O 11 1.258400( 11) 5 115.639( 35) 6 218.923( 58) 0 13 13 O 11 1.430000( 12) 5 114.994( 36) 6 25.479( 59) 0 14 14 N 13 2.718108( 13) 11 80.550( 37) 12 57.082( 60) 0 15 15 H 14 0.999900( 14) 13 100.968( 38) 11 3.887( 61) 0 16 16 H 14 1.000000( 15) 13 109.723( 39) 11 242.183( 62) 0 17 17 H 14 0.999900( 16) 13 -0.034( 40) 11 146.130( 63) 0 18 18 C 14 1.469900( 17) 13 105.823( 41) 11 118.136( 64) 0 19 19 H 18 1.069900( 18) 14 109.466( 42) 15 139.937( 65) 0 20 20 C 18 1.540000( 19) 14 112.071( 43) 15 260.340( 66) 0 21 21 H 20 1.070000( 20) 18 110.743( 44) 19 56.019( 67) 0 22 22 H 20 1.069900( 21) 18 110.910( 45) 19 177.805( 68) 0 23 23 H 20 1.070000( 22) 18 107.746( 46) 19 296.586( 69) 0 24 24 C 18 1.540000( 23) 14 110.431( 47) 15 388.028( 70) 0 25 25 O 24 1.258400( 24) 18 120.970( 48) 19 226.115( 71) 0 26 26 O 24 1.429900( 25) 18 112.719( 49) 19 42.156( 72) 0 --------------------------------------------------------------------------------------------------- Error termination via Lnk1e in /public/software/g09/l716.exe at Tue Apr 8 19:26:27 2014. Job cpu time: 4 days 6 hours 15 minutes 32.9 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 102 Int= 0 D2E= 0 Chk= 9 Scr= 1 請(qǐng)問(wèn)是什么原因？ |
9樓2014-04-08 20:52:51
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ddwy
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Cartesian Forces: Max 0.033266811 RMS 0.010627159 Error on Z-matrix card number 18 angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180. Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed: --------------------------------------------------------------------------------------------------- Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J --------------------------------------------------------------------------------------------------- 1 1 N 2 2 H 1 0.999900( 1) 3 3 H 1 0.999900( 2) 2 113.327( 26) 4 4 H 1 1.000000( 3) 2 103.184( 27) 3 243.699( 50) 0 5 5 C 1 1.507074( 4) 2 102.023( 28) 3 124.654( 51) 0 6 6 H 5 1.092731( 5) 1 111.792( 29) 3 296.095( 52) 0 7 7 C 5 1.520063( 6) 1 108.549( 30) 3 418.020( 53) 0 8 8 H 7 1.099728( 7) 5 111.981( 31) 6 59.228( 54) 0 9 9 H 7 1.096234( 8) 5 110.280( 32) 6 181.228( 55) 0 10 10 H 7 1.095524( 9) 5 109.302( 33) 6 300.028( 56) 0 11 11 C 5 1.550679( 10) 1 103.581( 34) 3 175.757( 57) 0 12 12 O 11 1.268267( 11) 5 109.983( 35) 6 196.169( 58) 0 13 13 O 11 1.241479( 12) 5 120.681( 36) 6 24.606( 59) 0 14 14 N 13 2.994519( 13) 11 73.437( 37) 12 69.560( 60) 0 15 15 H 14 0.999900( 14) 13 81.014( 38) 11 39.965( 61) 0 16 16 H 14 1.000000( 15) 13 67.355( 39) 11 288.730( 62) 0 17 17 H 14 0.999900( 16) 13 60.723( 40) 11 163.040( 63) 0 18 18 C 14 1.497252( 17) 13 180.139( 41) 11 201.204( 64) 0 19 19 H 18 1.097137( 18) 14 106.727( 42) 15 80.427( 65) 0 20 20 C 18 1.510911( 19) 14 113.920( 43) 15 204.013( 66) 0 21 21 H 20 1.097850( 20) 18 111.975( 44) 19 60.275( 67) 0 22 22 H 20 1.097859( 21) 18 110.844( 45) 19 182.139( 68) 0 23 23 H 20 1.093161( 22) 18 108.174( 46) 19 299.782( 69) 0 24 24 C 18 1.572212( 23) 14 102.983( 47) 15 329.640( 70) 0 25 25 O 24 1.281244( 24) 18 113.300( 48) 19 270.491( 71) 0 26 26 O 24 1.217731( 25) 18 117.612( 49) 19 88.389( 72) 0 --------------------------------------------------------------------------------------------------- Error termination via Lnk1e in /public/software/g09/l716.exe at Thu Apr 3 18:36:56 2014. Job cpu time: 3 days 11 hours 28 minutes 41.8 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 102 Int= 0 D2E= 0 Chk= 9 Scr= 1 謝謝你，上面是最后幾行的信息，這些內(nèi)容上面幾行是關(guān)于Forces (Hartrees/Bohr)的信息 |
3樓2014-04-04 08:50:26
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
ddwy: 金幣+10, ★★★很有幫助 2014-04-08 08:54:58
gmy1990: 金幣+1 2014-04-09 05:13:05
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Error on Z-matrix card number 18 angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180. 這是錯(cuò)誤原因，這一步的結(jié)構(gòu)貌似有問(wèn)題，所以 Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed 建議你排查一下結(jié)構(gòu)，或者用笛卡爾坐標(biāo) |
4樓2014-04-04 09:18:34
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