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[求助]
關(guān)于高斯ONIOM計(jì)算時(shí)， “ bonded-to“這個(gè)參數(shù)的使用問題
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求高人指點(diǎn)： 高斯ONIOM分層計(jì)算時(shí)，需要指定界面的低層（ Low layer）原子與高層（High layer）的哪一個(gè)原子成鍵（bonded-to參數(shù)來設(shè)定），我發(fā)現(xiàn)高斯test例子中就指定了High layer的一個(gè)原子與Low layer的某個(gè)原子成鍵。而我模擬的是High layer的兩個(gè)原子與Low layer的一個(gè)原子成鍵，這種情況如何來指定，輸入文件如何設(shè)定呢？ 看了一下gaussian manual中分子系統(tǒng)設(shè)定時(shí)的bonded-to參數(shù):”The 'bonded-to' parameter specifies which atom the current atom is to be bonded to during the higher-level calculation portion. If it is omitted, Gaussian will attempt to identify it automatically“。如果我不設(shè)定”bonded-to“參數(shù)，高斯是否會(huì)根據(jù)鍵長判斷出High layer的兩個(gè)原子都與Low layer的某個(gè)原子都成鍵呢？ |
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