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xjmayuan銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
求助群體顯著性差異比較方法 已有1人參與
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在已知多個(gè)群體基因座等位基因頻率的情況下如何，如何計(jì)算群體間顯著性差異的p值？或者能用什么軟件，我用卡方檢驗(yàn)試了結(jié)果不對（我用了R*C單向有序資料方法），哪位高手能否指點(diǎn)一二。(如下表P值，想知道這是怎么算出來的） Locus Uygur vs. Salar Ewenki Tibeta n Tu Han Yi India Iraq Pakistan Palestinian Turkey Nepal East Mongolia n D18S51 0.000 0.000 0.000 0.445 0.000 0.008 0.000 0.010 0.020 0.000 0.240 0.000 0.002 D21S11 0.000 0.091 0.000 0.612 0.029 0.000 0.000 0.007 0.000 0.001 0.005 0.001 0.001 D19S433 0.013 0.022 0.001 0.033 0.000 0.006 0.000 0.000 — — — 0.003 — D2S1338 0.000 0.000 0.000 0.000 0.082 0.000 0.000 0.000 — — — 0.000 — TH01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.017 0.155 0.031 0.001 0.000 0.000 D3S1358 0.000 0.103 0.000 0.091 0.211 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 — 0.002 0.265 VWA 0.000 0.000 0.003 0.001 0.005 0.000 0.000 0.001 0.062 0.000 0.018 0.000 0.000 CSF1PO 0.014 0.005 0.002 0.273 0.008 0.008 0.000 0.445 0.366 0.003 0.004 0.000 0.067 D5S818 0.000 0.127 0.452 0.115 0.002 0.048 0.000 0.016 0.003 0.001 0.063 0.000 0.003 TPOX 0.001 0.441 0.000 0.026 0.233 0.467 0.000 0.003 0.001 0.029 0.006 0.000 0.182 D13S317 0.000 0.000 0.030 0.001 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.013 0.000 0.001 D7S820 0.066 0.001 0.031 0.000 0.000 0.001 0.014 0.005 1.000 0.041 0.147 0.000 0.024 D16S539 0.002 0.012 0.008 0.650 0.012 0.501 0.281 0.001 0.359 0.565 0.000 0.000 0.263 D8S1179 0.000 0.038 0.004 0.259 0.001 0.000 0.000 0.001 0.000 0.029 0.396 0.000 0.198 FGA 0.000 0.338 0.000 0.001 0.000 0.000 0.000 0.003 0.000 0.001 0.000 0.000 1.000 |
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【答案】應(yīng)助回帖
 我算是找到了，糾結(jié)了一兩周，給你說說吧。就是用spss做的卡方檢驗(yàn)。不過對于原始數(shù)據(jù)，需要的是頻數(shù)而不是頻率（你可以個(gè)體數(shù)乘以2再乘以頻率，對應(yīng)出頻數(shù)）。然后就是需要你在spss里抄作了！有個(gè)示范：http://wenku.baidu.com/link?url= ... WsxgNcaQymO-bA7cP9_加油吧！學(xué)生物還要奔跑在統(tǒng)計(jì)學(xué)里的孩子！ |
3樓2015-04-23 09:31:20
【答案】應(yīng)助回帖
 最近我也在找這個(gè)，不過還沒確切的答案！ 最多的解釋就是：采用G—test(P<O.05)比較了XX與XX等位基因頻率的差異。 然后找到這個(gè)： Parental contributions were also compared between crosses and between samplingdays using G tests. x 2 and G tests were computed using SYSTAT 9.0Ž SPSS..也就是說用spss9.0 的G test 可以搞定！ 但是，我一直沒找到G test 指的什么方法！ 僅此參考！希望有用! |
2樓2015-04-20 16:14:44
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