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ddwy木蟲 (小有名氣)
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[求助]
經(jīng)典MD模擬的輸出文件REVCON以及HISTORY文件分析
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我做的經(jīng)典MD模擬最后得到了REVCON以及HISTORY等文件，但是不知道怎樣分子，嘗試提取這兩個文件中的原子坐標(biāo)信息后可以看到相應(yīng)團(tuán)簇的空間結(jié)構(gòu)，用Chem 3D軟件打開相應(yīng)的*.gjf文件，并對這個軟件中相應(yīng)的原子和離子半徑根據(jù)蘭氏手冊做了一些修改，但是重新打開文件后顯示的團(tuán)簇結(jié)構(gòu)很奇怪，成鍵信息很亂，想問一下大家，通過什么軟件工具可以看到相應(yīng)的空間三維結(jié)構(gòu)？除了Chem 3D軟件外，大家都用什么軟件來分析模擬結(jié)果？萬分感謝 |
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