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rst19860616金蟲 (正式寫手)
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[求助]
SNP的置換檢驗（permutation test）求助 已有1人參與
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本人最近在做SNP與一種疾病的關(guān)聯(lián)分析（association study），由于樣本量偏少些，所以想做置換檢驗（permutation tests）。我現(xiàn)在會使用Haploview做等位基因的permutation test，但對于additive model、recessive model、dominant model的permutation test就不懂怎么去做了，現(xiàn)誠心請教這方面的高手。如我的數(shù)據(jù)如下： healthy controls：A:147，C:117，AA:38，AC:71，CC:23; Cases：A:93，C:119，AA:20，AC:53，CC:33. 我現(xiàn)在對SPSS和stata有一點認識，可以在這兩種軟件里完成嗎？方便的話，高手可以將各個步驟講清楚些嗎？謝謝。 另外，我看很多文章都有用SPSS做SNP的Hardy-Weinberg equilibrium檢驗，但我試了幾次都不成功，高手可否將詳細步驟告知呢？比如數(shù)據(jù)的輸入、操作方法等。 在線急求，謝謝各位啦！ |
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rst19860616
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2樓2014-04-14 11:02:36
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3樓2021-01-14 16:58:20
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4樓2021-04-04 21:25:01
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