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262413748新蟲 (小有名氣)
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[求助]
高斯畫分子式計(jì)算優(yōu)化結(jié)構(gòu)的問題
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1.大家怎么畫圖的?復(fù)雜的分子式(270多個(gè)原子),通過chemdr-3d-gv里,結(jié)果鍵全亂了,最后自己在view里改了,為什么鍵會(huì)亂?有什么解決方法嗎? 2.我自己在view里改過后,計(jì)算遇到如下提示,然后終止了。是說分子之間太近造成終止了嗎? Atom 271 272 273 274 275 276 277 278 IAtWgt= 1 1 1 12 1 1 1 28 AtmWgt= 1.0078250 1.0078250 1.0078250 12.0000000 1.0078250 1.0078250 1.0078250 27.9769284 NucSpn= 1 1 1 0 1 1 1 0 AtZEff= 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 NQMom= 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 NMagM= 2.7928460 2.7928460 2.7928460 0.0000000 2.7928460 2.7928460 2.7928460 0.0000000 AtZNuc= 1.0000000 1.0000000 1.0000000 6.0000000 1.0000000 1.0000000 1.0000000 14.0000000 Leave Link 101 at Mon Apr 14 23:11:46 2014, MaxMem= 536870912 cpu: 4.5 (Enter /public/software/simulation/g09/l202.exe) Small interatomic distances encountered: 274 212 4.46D-01 Atoms too close. Error termination via Lnk1e in /public/software/simulation/g09/l202.exe at Mon Apr 14 23:11:46 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 5.2 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |
木蟲 (著名寫手)
新蟲 (小有名氣)
木蟲 (著名寫手)
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3樓: Originally posted by 262413748 at 2014-04-16 15:58:35 謝謝你的幫助,我看了下也是。還有個(gè)問題想咨詢您下,我調(diào)整了兩個(gè)原子位置,再計(jì)算優(yōu)化結(jié)構(gòu),結(jié)果很快算完了,但是本應(yīng)該是籠狀結(jié)構(gòu)的分子被打散了,也就是說化學(xué)鍵斷裂,請問是因?yàn)槲耶媹D時(shí)偏差比較大造成的嗎? ... 這種情況,首先你可以看下chk文件里的結(jié)構(gòu)是不是斷的,然后你看一下斷裂的兩個(gè)鍵之間的距離,如果鍵長數(shù)據(jù)是合理的話可以認(rèn)為沒問題。 如果不是的話,可能需要調(diào)整結(jié)構(gòu)了。 |
木蟲 (小有名氣)
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