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為什么基因在ensembl上的位置和Entrez上的位置不一樣 已有1人參與
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runx1 在ensemble 的位置是http://asia.ensembl.org/Homo_sap ... 5;t=ENST00000358356 Chromosome 21: 36,160,098-37,376,965 reverse strand. runx1 在Entrez的位置是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/861 Chromosome: 21; NC_000021.9 (34787801..35049334, complement) 而且兩者不屬于包含關(guān)系，為什么呢？ 并且我下了Affymetrix外顯子數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)runx1的位置在35082151-35343335，跟上述位置也是不包含關(guān)系，這樣子我就查不了哪個外顯子對應(yīng)的是哪個位置呢？ 求大神解答！ [ Last edited by wizardfan on 2014-4-20 at 00:21 ] |
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2樓2014-04-20 00:25:37
3樓2014-04-20 23:11:33
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4樓2014-04-21 06:06:23
5樓2014-04-21 09:12:27
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【答案】應(yīng)助回帖
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你給的鏈接無效。 不過根據(jù)所提供的發(fā)表日期， 2006年，這個太老了 GRCh37 Release date: March 3, 2009 GRCh38 Release date: December 24, 2013 勸你用38的數(shù)據(jù)，慢慢地大家都會轉(zhuǎn)移到這個版本上來 參考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/assembly/grc/human/ |
6樓2014-04-22 05:00:48
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http://www.affymetrix.com/support/mas/index.affx?hightlight=true&rootCategoryId=34001 不好意思，可能得通過上述連接才能進入，打開該網(wǎng)頁后選擇（Human Exon 1.0 ST Array）下面勾選（Annotation Files），然后點擊“go”，則打開另外一個網(wǎng)頁，找到HuEx-1_0-st-v2 Probeset Annotations, CSV, Release 20 (41 MB, 7/20/06) Comprehensive collection of annotations documented for each probeset on the NetAffx website in the csv format 另外，謝謝你的建議， 順便問一下怎么把金幣給你呢? |
7樓2014-04-22 23:29:23
wizardfan
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8樓2014-04-23 05:30:14
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