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VMD里看mdcrd 出問(wèn)題了 已有1人參與
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| 模擬過(guò)程是這樣: 蛋白質(zhì)分子里 固定所有原子 只有一個(gè)H原子在動(dòng) 我想在VMD里看過(guò)程的動(dòng)畫(huà)效果,也就是H轉(zhuǎn)移的過(guò)程,我先導(dǎo)入prmtop文件,文件類(lèi)型選擇AMBER 7 PARM ,再導(dǎo)入mdcrd文件,文件類(lèi)型選擇AMBER Coordinates, 然后看movie效果,有的時(shí)候是正常的,有的時(shí)候原子間會(huì)亂成鍵,但是我每次的操作是一樣的,請(qǐng)問(wèn)有人碰到過(guò)這個(gè)問(wèn)題嗎?是我的操作,或者文件不對(duì),還是VMD的Bug? |
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
浪客琴心

木蟲(chóng) (小有名氣)

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