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material studio的morphology模塊進(jìn)行分析，不支持無限配位聚合物怎么辦
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| 各位大神，我想用Materials Studio的Morphology模塊來進(jìn)行一下模擬，材料是一種金屬和有機(jī)配體形成的無限配位聚合物，但是算的時(shí)候軟件說不支持無限的體系，但是我看文獻(xiàn)上確實(shí)有算成功的例子，該怎么處理呢？Morphology模塊是不是只能算分子晶體這種有限的體系？第二個(gè)問題，在具體算的時(shí)候力場(chǎng)選擇好了之后，是選擇自動(dòng)標(biāo)記原子還是其他的？原子的電荷，之間的鍵是自動(dòng)還是手動(dòng)加上？非常感謝 |
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The growth morphology method cannot be applied to crystal structures containing an infinite network of bonded atoms. This is because the formation of surfaces in such systems involves breaking chemical bonds and bond breaking is not described by the available forcefields. The equilibrium morphology method cannot be applied to crystal structures containing an infinite network of bonded atoms. This is because the formation of surfaces in such systems involves breaking chemical bonds and bond breaking is not described by the available forcefields. 以上是關(guān)于為什么你的結(jié)構(gòu)不能計(jì)算的原因，簡(jiǎn)單說，晶胞內(nèi)，無窮長(zhǎng)分子鏈，例如聚乙烯晶胞，是不能用這兩個(gè)方法計(jì)算的 兩個(gè)解決辦法 1、BFDH，BFDH會(huì)生成一個(gè)數(shù)據(jù)表，包含晶面間距d，這個(gè)d值與最終形貌有關(guān)，根據(jù)d值刪除不可能成面的hkl，修正形貌，看是否與實(shí)際情況符合 2、除BFDH外的兩種方法限制了無窮長(zhǎng)鏈，既然如此，就把結(jié)構(gòu)改成有限長(zhǎng)度 定義一晶胞鏈長(zhǎng)尾1單元，建立10單元長(zhǎng)鏈，放入比10倍長(zhǎng)度多點(diǎn)的晶胞內(nèi)，末端封閉。不是無窮長(zhǎng)鏈，就符合growth 、equilibrium的計(jì)算要求了 |
6樓2014-04-28 08:53:08
7樓2014-04-28 09:02:54
8樓2014-04-28 09:07:11
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