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duanepp木蟲 (小有名氣)
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[交流]
migrate-n 軟件使用的一些困惑
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關(guān)于migrate軟件的疑問 1.我的數(shù)據(jù)格式為微衛(wèi)星，選擇data type時(shí)選擇哪種？ 2.選擇搜索策略是為Bayesian Inference 第八項(xiàng) long chain 為1 第九項(xiàng) sampling increment設(shè)置為多少 第十項(xiàng) record steps in chain設(shè)置為多少 第十一項(xiàng) burn-in of each chain設(shè)置為多少 第十二項(xiàng)replicates設(shè)置為多少 3.第十三項(xiàng) heating migrate的3.6.4版中heating scheme中刪除了adaptive選項(xiàng)，這里該選擇什么？static？ 4.再選擇static后 different heated chain 設(shè)置為4（？），然后swapping tree 設(shè)置為1（？） 在3.2.15中設(shè)置coldest temperature中的例子為1.0 1.5 3 0 6.0，而3.6.4版中為1.0 1.5 3.0 1000000.0，這個(gè)地方如何設(shè)置？ 5. migrate要計(jì)算四次，第一次Theta和M值是由FST計(jì)算得到，后面的三次是如何得到和設(shè)置的 |
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2014-04-28 14:53:36, 63.5 K
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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| 樓主您好，我也在做SSR分析，最近在找這款軟件，能分享么，謝謝，puposl@swu.edu.cn，同時(shí)希望能多交流學(xué)習(xí) |
8樓2015-07-14 16:46:27
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