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missducksong銅蟲 (小有名氣)
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使用Multiwfn計(jì)算的乙醇體積和查到的數(shù)據(jù)偏差很大，求前輩解析原因！ 已有1人參與
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1、本人使用Multiwfn計(jì)算出的乙醇體積為74.63736 angstromˆ3; 2、在網(wǎng)站http://www.basechem.org/chemical/1182查到的乙醇范德華體積為：31.940（cm3·mol-1）； 3、又單位換算：1 angstrom=0.1納米； 算出的數(shù)據(jù)和網(wǎng)上查到的數(shù)據(jù)差別怎么這么大呢？這數(shù)據(jù)還能用嗎？是哪邊出問題了呢？求指導(dǎo)，謝謝！ 乙醇數(shù)據(jù).jpg |
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我來回答一下吧。。。 multiwfn算的是單個(gè)乙醇分子的體積。網(wǎng)上的數(shù)據(jù)是一摩爾乙醇分子的體積（注意那個(gè)mol^-1的單位）。 60.46545 angstrom^3 = 60.46545 x 10^-24 cm^3， 相當(dāng)于60.46545 x 10^-24 x 6.022 x 10^23 cm^3 mol^-1 = 36.4 cm^3 mol^-1。與網(wǎng)上的31.9就相差不多了�？紤]到單分子與凝聚態(tài)的差距，這個(gè)結(jié)果應(yīng)該是合理的。 |
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missducksong12樓2014-05-27 23:27:49
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有幾個(gè)問題要注意 1 Multiwfn默認(rèn)的電子密度0.001等值面定義的范德華表面是氣相的，分子間沒有接觸、擠壓，必然偏大。通常推薦用0.002等值面當(dāng)成凝聚相的范德華體積 2 你查到的體積數(shù)據(jù)是具體怎么得來的，這得搞清楚。應(yīng)該手動(dòng)算一下是不是通過密度和分子質(zhì)量換算來的。 3 假設(shè)你查到的就是換算而來的，Multiwfn算出來的與它也必然有差異。如《談?wù)劮肿芋w積的計(jì)算》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/2707923863a0fd5b80f1a7df）所討論的，從計(jì)算角度上來說，體積的定義本來就是含糊的，雖然0.002等值面是一種相對(duì)較為合理、有意義的定義，但這樣得到的終究是單分子性質(zhì)，只考慮單個(gè)分子自身。而查到的則是從分子凝聚相性質(zhì)（密度）上換算來的。由于分子間復(fù)雜的相互作用，不可能那么簡(jiǎn)單地就很好對(duì)應(yīng)上。但可以擬合個(gè)方程來將0.002等值面包圍的體積和實(shí)驗(yàn)體積關(guān)聯(lián)起來。 |
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2樓2014-05-26 15:07:21
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8樓2014-05-26 23:21:35
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14樓2014-05-30 04:14:26
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在0.002等值面下，使用multiwfn程序重新對(duì)乙醇（C2H6O）的分子表面進(jìn)行了分析。 得出：(1)體積=60.46545angstromˆ3；(2)面積=82.42776angstromˆ2 這些值和在物競(jìng)化學(xué)品數(shù)據(jù)庫http://www.basechem.org/chemical/1182查到的：——體積31.940（cm3·mol-1）——表面積4.930×109（cm2·mol-1） 雖說分子表面沒有唯一定義，導(dǎo)致不同分子表面定義就會(huì)給出不同的分子體積定義，致使所計(jì)算出來的值和從數(shù)據(jù)庫查到的值不能很好對(duì)應(yīng)上，，，但這個(gè)差值的確還是挺大的哈。 如何擬合個(gè)方程來將0.002等值面包圍的體積和實(shí)驗(yàn)體積關(guān)聯(lián)起來呢？ 我現(xiàn)在使用的這種方法計(jì)算出來的體積值、面積值如果正確的話，能不能直接用于對(duì)這個(gè)乙醇分子的量化分析呢？ 還是說這個(gè)計(jì)算出來的值和數(shù)據(jù)庫中的值差別比較大 一定要擬合個(gè)方程把其關(guān)聯(lián)起來才能使用呢？ |
7樓2014-05-26 22:11:41
9樓2014-05-27 00:08:20
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