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moye1991新蟲 (初入文壇)
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[求助]
求助：gromacs怎樣進(jìn)行REMD的計(jì)算？ 已有2人參與
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求助各位有經(jīng)驗(yàn)的前輩，用gromacs怎樣進(jìn)行REMD的計(jì)算，有操作過的大俠嗎？求指導(dǎo)，tutorial上只有原理，沒有實(shí)際操作方法，不會實(shí)際操作啊~ |
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jianchen7882
金蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
月只藍(lán): 金幣+2, 鼓勵(lì)交流！ 2014-05-30 20:16:35
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月只藍(lán): 金幣+2, 鼓勵(lì)交流！ 2014-05-30 20:16:35
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http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... lysozyme/index.html 這個(gè)網(wǎng)址可以做，在最后結(jié)果分析那呢，具體也有一些中文教程，百度文庫好像就有，水中的溶菌酶 吧 大約搜 |
2樓2014-05-29 17:30:50
moye1991
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 183
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3樓2014-06-01 10:41:55
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
moye1991: 金幣+15, ★★★很有幫助, 好的，非常感謝~ 2014-06-05 10:57:21
moye1991: 金幣+15, ★★★很有幫助, 好的，非常感謝~ 2014-06-05 10:57:21
| 溫度副本交換模擬啊，這個(gè)估計(jì)一句話兩句話教不會你啊，你可以去gromacs的官網(wǎng)http://www.gromacs.org/Documentation/Tutorials上看，那里有一個(gè)比較詳細(xì)的介紹，然后你在自己學(xué)習(xí)一下溫度副本的設(shè)置，跑模擬的過程都是一樣的，最后就是在分析的時(shí)候有差別，需要對軌跡文件，能量文件自己處理，那個(gè)就是后期的工作了，你先把前期工作學(xué)會了，后邊的分析可以到時(shí)候在學(xué) |
4樓2014-06-04 12:43:14
5樓2015-01-05 15:01:34
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