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[交流]
國產(chǎn)分子動力學(xué)計算軟件BeeMD正式上線,歡迎下載測試 已有32人參與
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如題,歷經(jīng)十多年開發(fā),包含計算、分析和可視化全套。 計算速度和主流MD軟件一樣,自動多線程(OpenMP),MPI并行,CUDA 完全免費,歡迎大家使用。請到 BeeMD.org 查看更多介紹。 我們已經(jīng)成立了自助開發(fā)團隊,誠邀各方大拿參加開發(fā), 急需如下方面合作開發(fā),有底子的才俊別保留啊, .....SIMD優(yōu)化, .....單精度優(yōu)化, .....CUDA優(yōu)化, .....QM模塊, .....力場開發(fā)。 速度:雙精度版本和GROMACS差不多了,還未做單精度優(yōu)化。 特點:我們注重增強采樣相關(guān)開發(fā),支持script編程,擴展開發(fā)比GROMACS,AMBER,NAMD容易,還有就是國產(chǎn),我們能給國內(nèi)用戶提供面對面的使用和開發(fā)交流,為用戶實現(xiàn)特定需求開發(fā)。 附件中是Windows下多線程版本的binaries,其它系統(tǒng)的請到主頁下載, 如需從源碼編譯,請聯(lián)系我們[ Last edited by beeMD on 2014-6-11 at 11:06 ] 這個MD軟件大概構(gòu)架和功能我們已都開發(fā)好,做基本的MD應(yīng)用計算應(yīng)該足夠了,希望大家用這個軟件做些工作,如果有好的應(yīng)用可聯(lián)系我們,我們可幫著作,希望有能力的才俊能來參加開發(fā),起點赿低赿好,有一定C語言基礎(chǔ)即可,自愿參與,我們不發(fā)工資的,但會給做些初步的開發(fā)培訓(xùn),國外MD軟件也不是一天寫成的,拋磚引玉,希望能有真正創(chuàng)新能力的后來者,這個事情國內(nèi)總得有人做,請大家多多支持。! 目前急尋自主QM Module,有知道的學(xué)友請幫忙引薦 [ Last edited by beeMD on 2014-6-12 at 23:49 ] 我雖已不做學(xué)術(shù),還是給下本人的簡介,去年年底開始組建Modar開發(fā)團隊,隊里的其他成員,等我征得他們同意后公布, 2005 中科院生物物理所畢業(yè), 2005-2011 Florida State University, 2011 回國創(chuàng)業(yè), 剛回國前兩年沒大多時間打理MD開發(fā),最新有些時間出來和大家交流,請大伙多多支持。! 學(xué)術(shù)上幾乎沒有成就,拿的出手的是篇共同一作的PNAS的算法短文,如感興趣,請大伙自行搜索 "Random walk in orthogonal space to achieve efficient free-energy simulation of complex systems" 在些我感謝Dr. Wei Yang對我放棄學(xué)術(shù)工作的理解 之前開發(fā)過一個可視化軟件,詳見 noch dot sourceforge dot net 曾經(jīng)也有不少歐美學(xué)者使用,后來出國工作沒時間維護,現(xiàn)在更名為Movar 打包在Modar中,Modar是10多年龜速積累的結(jié)果,希望國內(nèi)的學(xué)者能多做些開發(fā)工作,有能力就來接管我們的開發(fā)工作。 [ Last edited by beeMD on 2014-6-13 at 12:57 ] |
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