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請大家?guī)椭医鉀Q下找過渡態(tài)中的燃眉之急 謝謝！卡好久了。。。 已有3人參與
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最近找過渡態(tài)都是TS先用HF/3-21G找到后再用大基組m062x/6-31g*跑，但是最近的幾個過渡態(tài)都是用小基組找到了，但是讀CHK時候 跑不出來，兩個途徑的問題分別是兩種情況：1.一種是過渡態(tài)能量一直小范圍震蕩，都到0.000X了但就是不平，需要加什么關鍵詞或者怎樣？加gdiis管用么？或者加IOP=(1/8=8)? 2：一種是一個成環(huán)(C=C和一個N成環(huán)，成環(huán)后下一步是H轉(zhuǎn)移到C=C另一個C上），小基組虛頻都是400多500多，但是讀CHK后成環(huán)兩個原子反而跑遠了，無法成環(huán)，體系中氫鍵作用比較多，是不是HF和M062X方法之間的誤差問題？有什么好辦法解決么？基函數(shù)一千一左右，不用小基組直接TS的話跑1002就得一天多。。。太費時間了。。請大家指點下我該咋整，一個多月一點進展都沒有，很焦急。。 先謝謝大家了，請大家不吝賜教，感激不盡！ |
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3樓2014-07-04 10:12:02
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1、可以加gdiis，如果再沒用的話我一般是把振蕩的那幾個結構拿出來單獨算頻率看看。 2、6-31g*我覺得不算大機組。大機組怎么也得到6-311++g(d,p)吧。。。而且你氫鍵多，為何不加彌散？我覺得加到6-31++g(d)。用HF給個初始結構和初始猜我覺得沒問題，但是用來算弱相互作用我個人認為是“無意義”的， 如果是高斯09d以上版本的話可以用DFT-D，解決弱相互作用比較不錯。 http://hi.baidu.com/sobereva/item/3cbf8904defdc4803d42e2e9 大神的這篇文章可供參考。 個人見解，歡迎批評指正。 |
2樓2014-07-04 10:10:53
jyzhao1981
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| 對于你的第一個問題，加gdiis能解決。第二個反應直接用m062x/6-31g**做一個柔性掃描去尋找過渡態(tài)。你的體系中有氫鍵，泛函選的對，但基組至少要用6-31g**了。算1002花一天多的時間多正常的事情啊，你怎么那么急呢。對于含有非鍵作用的體系，HF很難給出正確的結果，它忽略了大部分電子相關啊。 |
4樓2014-07-04 12:32:12
5樓2014-07-08 08:49:55
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