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pdl9527

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[求助] 如何通過Mulliken_Analysis和Hirshfeld_Analysis來判斷原子的雜化類型

以下是我計(jì)算己烷得到的結(jié)構(gòu)，如何通過以上的分析手段得到碳的雜化類型呢？
我不知道這種方法行不行，只是看到文獻(xiàn)中用到了，如果不行在dmol3中有其他的方法么？
ps:我不是做第一性的，只是需要用一下，能不能說點(diǎn)直白的，萬分感謝！

還有一些population的分析結(jié)果太多就沒弄上來了。

Charge partitioning by Hirshfeld method: (  0.0000 0.0000)
  C    1 charge spin                -0.1096 0.0000
  C    2 charge spin                -0.0617 0.0000
  C    3 charge spin                -0.0634 0.0000
  C    4 charge spin                -0.0634 0.0000
  C    5 charge spin                -0.0617 0.0000
  C    6 charge spin                -0.1096 0.0000
  H    7 charge spin                   0.0343 0.0000
  H    8 charge spin                   0.0343 0.0000
  H    9 charge spin                   0.0367 0.0000
  H 10 charge spin                   0.0329 0.0000
  H 11 charge spin                   0.0329 0.0000
  H 12 charge spin                   0.0319 0.0000
  H 13 charge spin                   0.0319 0.0000
  H 14 charge spin                   0.0319 0.0000
  H 15 charge spin                   0.0319 0.0000
  H 16 charge spin                   0.0329 0.0000
  H 17 charge spin                   0.0329 0.0000
  H 18 charge spin                   0.0343 0.0000
  H 19 charge spin                   0.0367 0.0000
  H 20 charge spin                   0.0343 0.0000

Mulliken atomic charges:
      charge spin
C (  1)  -0.965 0.000
C (  2)  -0.582 0.000
C (  3)  -0.570 0.000
C (  4)  -0.570 0.000
C (  5)  -0.582 0.000
C (  6)  -0.966 0.000
H (  7) 0.302 0.000
H (  8) 0.302 0.000
H (  9) 0.321 0.000
H ( 10) 0.308 0.000
H ( 11) 0.308 0.000
H ( 12) 0.288 0.000
H ( 13) 0.288 0.000
H ( 14) 0.288 0.000
H ( 15) 0.288 0.000
H ( 16) 0.308 0.000
H ( 17) 0.308 0.000
H ( 18) 0.302 0.000
H ( 19) 0.321 0.000
H ( 20) 0.302 0.000

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1樓 2014-07-12 19:29:46

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你指的雜化指的是雜化軌道還是？我默認(rèn)前者吧。
布居分析（如Mulliken和Hirshfeld）的概念其實(shí)就是鍵電子歸屬方式，得不到雜化的方式。想要得到雜化的形式需要了解鍵電子的成分，Dmol3得到的軌道系數(shù)我不確定是否經(jīng)過正交化。Dmol3的投影態(tài)密度有缺點(diǎn)，沒辦法進(jìn)行磁量子數(shù)分波�；蛘唛g接的方式就是通過鍵級(jí)進(jìn)行分析，可在性質(zhì)中選擇bond order，原則上來說，單鍵的鍵級(jí)接近1，但是也有偏離的時(shí)候。

如果想更好一些，有下列建議：
這方面的工作Gaussian、ADF或是Molpro等程序可能有更好更專業(yè)的方式，如AIM及其他，Dmol3確實(shí)在這方面有些不足。關(guān)于電子結(jié)構(gòu)分析可以請(qǐng)教量子化學(xué)版的Sobereva，他們寫了Mulitiwfn對(duì)電子結(jié)構(gòu)分析非常有益，或是找找他的帖子，他肯定有更高明的辦法。

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2樓2014-07-14 02:25:59