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newton-HIT金蟲 (初入文壇)
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[求助]
ion set Q at origin recip failure to write recip Q0錯誤解決方法 已有1人參與
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linux版本的CASTEP在進(jìn)行較大體系計(jì)算時(shí)(較多的k點(diǎn)或者聲子計(jì)算)發(fā)生的錯誤提示： Error: ion_set_Q_at_origin_recip: failure to write recip_Q0_save to page file Current trace stack: ion_set_Q_at_origin_recip ion_int_Q_at_origin_recip nlpot_calculate_d band_structure_calculate_all run_band_structure castep 利用網(wǎng)絡(luò)和幫助文檔搜索了一下相關(guān)錯誤原因，一般認(rèn)為是計(jì)算臨時(shí)存儲文件夾設(shè)置太小的原因（http://www.gaoyang168.com/html/201104/3055044.html），建議修改計(jì)算臨時(shí)文件存放位置。 于是按照幫助文件中的提示找到安裝文件夾下面的~/share/bin/ms_setup.sh 發(fā)現(xiàn)默認(rèn)的臨時(shí)文件夾為/tmp.單位集群將該文件夾設(shè)置為10G，多人提交計(jì)算任務(wù)時(shí)的確容易造成文件夾占滿。 修改其中的代碼如下： gatewaytmp="/home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/tmp" I_MPI_MPD_TMPDIR=/home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/tmp 然后在安裝賬戶相應(yīng)的目錄下建立tmp文件夾 重啟后提交計(jì)算任務(wù)發(fā)現(xiàn)報(bào)錯代碼依舊，計(jì)算臨時(shí)文件依然在根目錄/tmp下，修改并不成功。求助修改成功達(dá)人指點(diǎn)迷津。 |
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4樓2024-12-30 17:21:18
四夕一
鐵蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
2樓2015-12-24 10:52:10
馮亞娟
金蟲 (正式寫手)
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- 注冊: 2013-10-13
- 性別: MM
- 專業(yè): 原子和分子物理
【答案】應(yīng)助回帖
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參考一下help 文檔： DMol3 > DMol3 jobs > If a remote DMol3 job fails 或者CASTEP > CASTEP jobs > If a remote CASTEP job fails。 大體操作如下所示： 0. 使用管理員賬戶登錄（root賬戶）； 1. 服務(wù)器磁盤是否已滿。 使用命令：df -h，查看是否有使用100%的磁盤； 2. 確定CASTEP臨時(shí)文件的存儲位置是否在占用100%的磁盤；locate ms_vars.sbd文件, ms_vars.sbd文件中GATEWAY_TMP內(nèi)容，默認(rèn)是/tmp 3. 將/tmp內(nèi)容清空；使用命令：cd /tmp; rm -rf * 4. 如果 /tmp目錄所在磁盤空間較小，可以更改GATEWAY_TMP目錄至指定目錄。 |
3樓2018-04-24 17:35:24
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