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新蟲 (初入文壇)

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專業(yè): 高分子組裝與超分子結(jié)構(gòu)

[求助] 求教關(guān)于剪切場方面的in文件

我查過手冊和相關(guān)資料，說用fix deform來達(dá)到剪切場的目的，但是手冊上寫著是改變盒子形狀（我把in文件貼出來），說白了就是壓縮和拉伸的作用，我也運(yùn)算了一些結(jié)果，除了單純達(dá)到拉伸和壓縮外并不能達(dá)到結(jié)構(gòu)的變化。我想請教誰有研究過剪切場的相關(guān)內(nèi)容，可否說一下該怎么辦嗎？還有剪切場與速度梯度有關(guān)，但是velocity指令只是改變粒子初始速度啊，其中有個ramp是產(chǎn)生速度梯度的，但是運(yùn)行的時(shí)候提示要設(shè)置lattice命令，可是我的in文件與lattice無關(guān)的。

dimension                3
boundary                p p p
units                      lj
atom_style                molecular

neighbor                   0.3 bin
neigh_modify             every 1 delay 0

read_restart             run.1.restart

bond_style                harmonic
bond_coeff                1  10.0 0.86

pair_style                dpd 1.0 1.0 34387
pair_coeff                1  1  15.0  4.5  1.0
pair_coeff                2  2  15.0  4.5  1.0
pair_coeff                1  2  50.0  4.5  1.0

#velocity                   all  create 1.0  4928459  dist  gaussian
communicate single vel yes
timestep                   0.00001
thermo                   100000

fix                      1 all nve
fix                      2 all deform 1000 x erate 0.0005 remap v

dump                      1 all custom 100000 dump.a5b5.lammpstrj id type x y z
run                      1000000
write_restart run1.restart

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1樓 2014-07-14 14:43:38

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