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heropighi銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
MS-Castep葉綠素分子模擬 已有1人參與
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小妹最近在嘗試葉綠素分子的模擬,建置完結(jié)構(gòu)後,進(jìn)行光學(xué)分析,但似乎是結(jié)構(gòu)出了點(diǎn)問題 想請(qǐng)問有哪位好心人能提供這個(gè)分子的結(jié)構(gòu)讓小妹參考參考嗎? |
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heropighi
銅蟲 (小有名氣)
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5樓2014-07-27 20:05:35
月只藍(lán)
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2樓2014-07-26 14:24:35
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3樓2014-07-26 14:28:45
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【答案】應(yīng)助回帖
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您要研究的是單個(gè)分子，對(duì)嗎？不是葉綠素晶體吧？ 如果是繪制單個(gè)分子，用Sketch Atom，根據(jù)分子的化學(xué)式，繪制出來整個(gè)分子結(jié)構(gòu)，然后Clean幾下即可。一般說來，人工繪制分子結(jié)構(gòu)，不必太在意鍵長(zhǎng)、鍵角這些問題，因?yàn)楹罄m(xù)的幾何優(yōu)化正是為了計(jì)算出能量最低的分子結(jié)構(gòu)。 如果還有問題，最好把問題詳細(xì)給出，包括軟件的錯(cuò)誤提示信息，以截圖的方式發(fā)上來。 |
4樓2014-07-26 15:00:15
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