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zhourb1111新蟲 (初入文壇)
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[交流]
MALDI-TOF-MS圖譜分析 已有3人參與
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該結果是目標蛋白從膠上切下來后用trypsin處理后做MALDI-TOF-MS得到的結果，在http://www.matrixscience.com/cgi ... &SEARCH=PMF中檢索沒有結果，現(xiàn)在不會分析了，比如該蛋白分子量是多少，求給位幫幫忙，謝謝了。 MS.png |
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袁1231
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2樓2014-08-13 22:13:36
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樓主這樣明顯把問題復雜化了，要是這樣，你要用肽指紋圖譜(PMF)進行搜索了，你完全可以直接不酶切做MALDI-TOF-MS，分子量就直接出來了。用要用肽指紋圖譜(PMF)進行搜索實際上用于未知的蛋白質的鑒定，即從蛋白質數據庫中找到與庫中的同樣的酶切片段的各個肽段的分子量信息與實驗的蛋白質最為匹配的蛋白質是誰，然后鑒定出未知的蛋白質的身份信息。 我另外提供給樓主簡單些的肽指紋圖譜(PMF)為基礎的未知蛋白質的身份確定的搜索方法�？梢杂茫篗ascot軟件，從網上其搜索界面直接填好信息提交給Mascot，它自己就會完成搜索并給于你搜索的可能的匹配的蛋白質的信息。 Mascot軟件的PMF提交界面就是：http://www.matrixscience.com/cgi ... &SEARCH=PMF ，樓主寫對了，然后你按照界面的要求把信息填好提交就行了。可以參考：參見：薛慶中 等編著，DNA和蛋白質序列數據分析工具，科學出版社，2012，第三版，146-151，該書用的是http://www.matrixscience.com/cgi ... &SEARCH=MIS 提交界面，操作大同小異。 DNA和蛋白質序列數據分析工具_(第三版）下載：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7614763 Mascot網上提交界面(PMF).JPG |
3樓2014-08-13 23:35:29
wizardfan
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4樓2014-08-14 08:38:06
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