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Hector_BioQ銀蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
請(qǐng)教iTRAQ和Label Free的蛋白定量相關(guān)問(wèn)題 已有1人參與
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請(qǐng)問(wèn)下版上的質(zhì)譜高手,小弟的問(wèn)題是這樣的: 共有7個(gè)蛋白混合樣品,其中一個(gè)是對(duì)照組,需要得到的信息是:1.每個(gè)樣品中蛋白的種類;2.每個(gè)樣品中所含蛋白的豐度;3.各組樣品間相同蛋白的含量的相對(duì)差異。 目前知道的是iTRAQ和Label Free都是可以做到第一條和第三條的。但是咨詢了國(guó)內(nèi)的一些公司,大多數(shù)都不能實(shí)現(xiàn)第二條,但是文獻(xiàn)里使用Label Free的技術(shù)(引入內(nèi)參)是可以對(duì)同一樣品中各類蛋白的豐度做出定量分析的。公司給的答復(fù)是國(guó)內(nèi)技術(shù)水品不能夠?qū)崿F(xiàn)。請(qǐng)問(wèn)真的是這樣的么?另外,通過(guò)對(duì)同一樣品里不同蛋白肽段數(shù)的分析不能夠獲得各自的豐度信息么? |
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同一樣品中不同肽段數(shù)也不代表樣品的豐度 第一,肽段分為特異的和非特異的兩種,非特異肽段在幾種蛋白中都有,你不能確定它到底是哪一種蛋白的 第二,就算不存在第一點(diǎn),肽段有長(zhǎng)有短,質(zhì)譜儀檢測(cè)不同肽段的能力也有不同 |
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