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關(guān)于MS吸附模擬中遇到的幾個(gè)問題，希望各位前輩能給予解答
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小弟初學(xué)MS，看了一段時(shí)間教程，可是原來不是做這方面的，現(xiàn)在老板讓做分子篩吸附氣體的模擬，上手起來進(jìn)度緩慢，好多專業(yè)名詞都不了解，找了一篇做分子篩吸附CO2的文獻(xiàn)，想按照文中的步驟試著做一下，邊做邊學(xué)。在模擬過程中有些問題不太明白，希望有前輩能給予指導(dǎo)和解答，先在此謝過了。 1.吸附劑為13X-APG，文獻(xiàn)中是用的MS中自帶的FAU結(jié)構(gòu)，然后進(jìn)行修改，F(xiàn)AU （Al96 Si96 O384）,13X-APG為Na86 Al86 Si106 O384，因此需要將結(jié)構(gòu)中的10個(gè)Al替換為Si，并加入86個(gè)Na。文獻(xiàn)中替換的是5個(gè)特定位置的Al，正反面各5個(gè)。請(qǐng)問為什么要替換這5個(gè)位置的Al，遵循的是什么規(guī)則？ 2.向結(jié)構(gòu)中加入86個(gè)Na原子，是把Na當(dāng)做吸附質(zhì)，結(jié)構(gòu)當(dāng)做吸附劑，使用sorption中的locate來做，請(qǐng)問這樣做正確嗎？設(shè)置與吸附后結(jié)構(gòu)如下圖 3.吸附完成后使用Forcite進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化，設(shè)置如下圖，請(qǐng)問這樣做是否正確，還有這個(gè)結(jié)構(gòu)優(yōu)化的原理是什么，要達(dá)到一個(gè)什么目的。 4.在forcite優(yōu)化完成后還要進(jìn)行Dmol3計(jì)算嗎，ESP電荷是起到什么作用的，這里不理解。文獻(xiàn)中3個(gè)簇模型原子電荷是干什么用的。 暫時(shí)是這些不理解的地方，初學(xué)MS，原來也從未接觸過這方面的知識(shí)，學(xué)起來感覺一頭霧水，十分迷茫。希望各位前輩能給一個(gè)吸附模擬的大體脈絡(luò)，要進(jìn)行哪些步驟，入門有哪些書推薦看一下，能對(duì)這些基礎(chǔ)理論有個(gè)了解，MS中的各模塊具體的作用是干什么的，教程中寫的太簡(jiǎn)略，只知道他們的字面作用，卻根本不知道該什么時(shí)候用，怎么用。希望各位不吝賜教，萬分感激！ 捕獲1.PNG [ Last edited by 月只藍(lán) on 2014-8-19 at 09:12 ] |
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