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chenjingzhi金蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
關(guān)于martyna版nose-hoover控溫控壓方法
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| 在martyna的1996年的論文“Explicit reversible integrators for extended system dynamics”里面提到過(guò)，如果要使用這種劉維爾形式的方法進(jìn)行控溫控壓的話，那么分子的構(gòu)形保持算法，如SHAKE、RATTLE，就得進(jìn)行更改，但是論文里面所提出的受限算法卻是由上述的兩種混合組成的，第一步（這里使用的是velocity-verlet積分方法）使用SHAKE進(jìn)行控制，與nose-hoover chain相結(jié)合，循環(huán)直至得到的受限因子能夠使nose-hoover chain操作后的粒子間位置滿足鍵長(zhǎng)要求，接著是第二步移動(dòng)，過(guò)程與第一步相似，但是這里使用的卻是RATTLE算法，到底這是怎么一回事，是我理解有問(wèn)題嗎。我也找過(guò)其他相關(guān)的論文，卻發(fā)現(xiàn)他們給這種構(gòu)形保持算法取名為ROLL算法，那么說(shuō)似乎的確與SHAKE和RATTLE不同。求指點(diǎn)。 |
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2樓2014-08-22 08:24:36
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