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[求助]
配體的質子化狀態(tài)
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大家好，我正在做一個配體與受體的分子對接，用的軟件是autodock 配體是含多個羧基的化合物（不是氨基酸），有手性，在pubchem也找到它的mol2文件 但考慮到羧基的質子化狀態(tài)可能對對接結果影響比較大，所以有以下兩個問題： 1、如何判斷配體的質子化狀態(tài) 2、確定質子化狀態(tài)后如何修改？autodock可以直接修改嗎？或是用其它什么軟件？ 謝謝大家！ |
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