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hlxxym木蟲 (小有名氣)
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[求助]
已知一個新基因的CDS,如何利用軟件預(yù)測其結(jié)構(gòu),從而推測其表達(dá)的蛋白的類型、功能 已有3人參與
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請教一下各位 如果我對一個功能未知的基因(新基因)感興趣,我只知道他的CDS,將核酸序列翻譯成氨基酸序列以后,如何用軟件預(yù)測它的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)從而推測它的功能或者蛋白類型(比如酶、膜蛋白、受體)呢?能否列舉一下流程,并針對每個流程推薦一下軟件? 非常感謝! |
木蟲 (小有名氣)
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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蛋白結(jié)構(gòu)和功能的預(yù)測可以用EXPASY網(wǎng)站在線的一些工具,比如SMART可以根據(jù)序列預(yù)測三級結(jié)構(gòu)域。另外,Pfam網(wǎng)站也可以預(yù)測三級結(jié)構(gòu),還可以用于三級結(jié)構(gòu)比對來推測功能。 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |

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