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飛利白新蟲 (初入文壇)
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[求助]
MS-LAMMPS
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| 初始構(gòu)型是用MS構(gòu)建的晶胞，通過AC模塊之后，導(dǎo)出坐標(biāo)鍵角等信息運行LAMMPS，但是由于是聚合物長鏈，有很多原子處于盒子邊界外面（由于預(yù)設(shè)密度，盒子體積一定），所以運行LAMMPS時出錯，Bond atoms %d %d missing on proc %d at step %ld（cutoff是根據(jù)文獻(xiàn)設(shè)定的），或者Out of range atoms - cannot compute PPPM（neigh_modify命令已用。請問處于盒子外面的原子該如何處置呢，試過nvt和npt都不行 |
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2樓2015-11-15 14:20:01
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