 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 5021 | 回復(fù): 91 | |||||||||||||||
| 【獎勵】 本帖被評價84次，作者雷光月增加金幣 66.4 個 | |||||||||||||||
[資源]
★★★★★★2014書籍超級帖八四〇《蛋白質(zhì)工程手冊》
|
|||||||||||||||
|
書名Protein Engineering Handbook 作者Stefan Lutz and Uwe T. Bornscheuer 頁數(shù)992 出版社 wily ISBN: 978-3-527-31850-6 目錄Contents V Protein Engineering Handbook. Edited by Stefan Lutz and Uwe T. Bornscheuer Copyright © 2009 WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim ISBN: 978-3-527-31850-6 Volume 1 Preface XXVII List of Contributors XXXI 1 Guidelines for the Functional Analysis of Engineered and Mutant Enzymes 1 Dale E. Edmondson and Giovanni Gadda 1.1 Introduction 1 1.2 Steady-State Kinetics 2 1.3 Enzyme Assays and the Acquisition of Initial Velocity Data 3 1.3.1 Biological Sample Appropriate for Assay 3 1.3.2 Enzymatic Assays 4 1.3.3 Analysis of Initial Rate Data 6 1.3.4 Determination of Functional Catalytic Site Concentrations 8 1.4 Steady-State Kinetic Parameters and Their Interpretation 8 1.4.1 pH-Dependence of Steady-State Kinetic Parameters 11 1.4.2 Analysis of Two-Substrate Enzymes 11 1.5 Concluding Remarks 12 References 12 2 Engineering Enantioselectivity in Enzyme-Catalyzed Reactions 15 Romas Kazlauskas 2.1 Introduction 15 2.2 Molecular Basis for Enantioselectivity 18 2.2.1 Enzymes Stabilize Transition States for Fast-Reacting Enantiomers Better than Slow-Reacting Enantiomers 18 2.2.2 The Slow-Reacting Enantiomer Fits by Exchanging Two Substituents 18 2.2.3 The Slow Enantiomer Fits by an Umbrella-Like Inversion 19 2.3 Qualitative Predictions of Enantioselectivity 23 VI Contents 2.3.1 Comparing Substrate Structures Leads to Empirical Rules and Box Models 23 2.3.2 Computer Modeling Based on X-Ray Structures of Enzymes 25 2.3.3 What Is Missing from Current Computer Modeling? 26 2.4 Protein Engineering to Increase or Reverse Enantioselectivity 30 2.4.1 Mutations Closer to the Active Site Increase Enantioselectivity More Effectively than Mutations Far from the Active Site 30 2.4.2 Reversing Enantioselectivity by Exchanging Locations of Binding Sites or a Catalytic Group 36 2.5 Concluding Remarks 40 References 41 3 Mechanism and Catalytic Promiscuity: Emerging Mechanistic Principles for Identifi cation and Manipulation of Catalytically Promiscuous Enzymes 47 Stefanie Jonas and Florian Hollfelder 3.1 Introduction 47 3.2 Calculation of Rate Accelerations 52 3.3 Catalytic Features and Their Propensity for Promiscuity 55 3.3.1 Metal Ions 55 3.3.2 Recognition of Transition State Charges: Analysis of the Nature of the Transition State 61 3.3.3 Catalytic Dyads and Triads 63 3.3.4 General Acid/Base Catalysts in Promiscuous Functional Motifs in Catalytic Superfamilies 64 3.4 Steric Effects and Structural Constriction in the Active Site: Product Promiscuity 67 3.5 Medium Effects in Enzyme Active Sites 70 3.6 Conclusions 71 References 72 4 Φ-Value Analysis of Protein Folding Transition States 81 Neil Ferguson and Alan R. Fersht 4.1 Introduction 81 4.2 Theoretical Principles of Protein Engineering 82 4.2.1 Overview 82 4.2.2 Basic Concepts 83 4.2.3 Theory of Φ-Value Analysis 87 4.2.4 Relationship between Φ and Leffl er α 90 4.2.5 Linear Free-Energy Relationships and Denaturant Concentration 93 4.3 Guidelines for the Determination of Accurate Φ-Values 95 4.3.1 Buffer Preparation and Selection 96 4.3.2 Optimization of Experimental Conditions 97 4.3.3 Equilibrium Denaturation Experiments 99 4.3.3.1 Practical Considerations 99 Contents VII 4.3.3.2 Curve-Fitting 103 4.3.4 Kinetic Measurements 105 4.3.4.1 Practical Considerations 107 4.3.4.2 Curve Fitting 110 4.3.4.3 Error Analysis for Chevron Plots 113 4.4 Conclusions 115 Acknowledgments 116 References 116 5 Protein Folding and Solubility: Pathways and High-Throughput Assays 121 Adam C. Fisher, Thomas J. Mansell, and Matthew P. DeLisa 5.1 Introduction 121 5.2 Biosynthesis of Natural Proteins in Bacteria 122 5.2.1 Recombinant Protein Folding 122 5.2.2 Protein Misfolding and Inclusion Body Formation 123 5.2.3 Proteolysis 124 5.2.4 Cytoplasmic Chaperones 124 5.2.5 Export Pathways 125 5.3 Biosynthesis of de novo-Designed Proteins in Bacteria 126 5.4 Combinatorial Strategies for Assaying Protein Folding in Bacteria 126 5.4.1 Initial Protein-Folding Studies 128 5.4.2 Protein Chimeras 128 5.4.3 Split Proteins 129 5.4.4 Genetic Response 130 5.4.5 Cellular Quality Control Systems 130 5.5 Structural Genomics 131 5.6 Protein-Misfolding Diseases 132 5.7 Future Directions 135 5.7.1 Folding versus Solubility 137 References 138 6 Protein Dynamics and the Evolution of Novel Protein Function 147 Jörg Zimmermann, Megan C. Thielges, Wayne Yu and Floyd E. Romesberg 6.1 Introduction 147 6.2 Physical Background 149 6.2.1 Flexibility, Conformational Heterogeneity and Time Scales of Protein Dynamics 149 6.2.2 Protein Dynamics and Thermodynamics of Molecular Recognition 151 6.3 Experimental Studies of Protein Dynamics 153 6.3.1 NMR Relaxation Experiments 153 6.3.2 Ultrafast Laser Spectroscopy 154 6.4 Experimental Techniques 158 VIII Contents 6.4.1 Time-Correlation Function and the Spectral Density of Protein Motions 158 6.4.2 NMR Relaxation Techniques to Determine ρ(ω) 160 6.4.3 Ultrafast Laser Spectroscopy to Determine C(t) and e75351095673ef0cf35f839997dcef6f-d.jpg |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺，不對該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : S._Lutz,_U._Bornscheuer_-Protein_Engineering_Hand.pdf
2014-10-07 09:23:53, 13.58 M
» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 經(jīng)典資源帖 | 專業(yè)書籍（外文版）WM | 生物類電子書 | 蛋白質(zhì)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn) |
| 2014書籍超級帖 | 專業(yè)電子書 | 電子書資源 | uicorn3 |
| 分子生物學(xué) | 生物化學(xué)和分子生物學(xué) | 生物工程 | 生物學(xué) |
| 免疫 |
» 猜你喜歡
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：實(shí)驗(yàn)器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：和實(shí)驗(yàn)材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有184人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測：精準(zhǔn)分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之小鼠實(shí)驗(yàn)：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計，解析生命機(jī)制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之重金屬檢測：精準(zhǔn)篩查，守護(hù)健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
1949stone
榮譽(yù)版主 (知名作家)
- MolEPI: 4
- 應(yīng)助: 95 (初中生)
- 貴賓: 2.38
- 金幣: 2627.9
- 帖子: 9830
- 在線: 2692.8小時
- 蟲號: 765987
18樓2014-10-08 09:21:15
47樓2014-11-11 15:32:35
簡單回復(fù)
jinhx872樓
2014-10-07 09:48
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
2014-10-07 10:21
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
2014-10-07 12:08
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
2014-10-07 12:51
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
2014-10-07 14:46
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
2014-10-07 14:48
回復(fù)
頂一下，感謝分享！
平凡的高材生8樓
2014-10-07 16:36
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
2014-10-07 16:44
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
kehan77710樓
2014-10-07 19:22
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
xwj00711樓
2014-10-07 21:15
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
zhouxj12樓
2014-10-07 22:12
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
raychan199113樓
2014-10-08 00:05
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
cccu3314樓
2014-10-08 03:02
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
wtiger15樓
2014-10-08 08:27
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
liudr16樓
2014-10-08 09:00
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
1949stone17樓
2014-10-08 09:21
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
xl007133419樓
2014-10-08 09:41
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
fengcanluoye20樓
2014-10-08 10:13
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
1314168apple21樓
2014-10-08 12:07
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
soholj22樓
2014-10-08 12:29
回復(fù)
三星好評 頂一下，感謝分享！
cuils11111123樓
2014-10-08 13:35
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
霏凡蕊兒24樓
2014-10-08 20:00
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
yilifeifei25樓
2014-10-08 21:33
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
sulis26樓
2014-10-09 17:33
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
37364195227樓
2014-10-09 19:52
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
bobbycn28樓
2014-10-10 01:32
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
dectab29樓
2014-10-10 09:22
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
ykyang30樓
2014-10-10 09:23
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
lnf11731樓
2014-10-10 11:09
回復(fù)
一般 頂一下，感謝分享！
pumcnsy32樓
2014-10-10 14:08
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
zycneau33樓
2014-10-10 14:44
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
獨(dú)孤蠶34樓
2014-10-11 09:22
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
wendy7335樓
2014-10-11 09:27
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
得意地笑36樓
2014-10-11 13:59
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
hongdan37樓
2014-10-11 14:43
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
hanlong3338樓
2014-10-13 22:40
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
itianya39樓
2014-10-13 23:21
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
wxy_080840樓
2014-10-16 16:32
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
zhangzhilai41樓
2014-10-21 14:37
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
夏天過后過后42樓
2014-10-21 14:41
回復(fù)
五星好評 感謝分享！
jennylife43樓
2014-11-04 21:43
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
fisherrx44樓
2014-11-08 10:11
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
tomajack45樓
2014-11-09 08:51
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
zhwenxing46樓
2014-11-10 16:35
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
萬海付48樓
2014-11-18 22:40
回復(fù)
頂一下，感謝分享！
supperch_rj49樓
2014-11-19 00:22
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享�。� [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ]
氫化大雪50樓
2014-11-21 19:00
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 雷光月 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +6 | 冷笙123 2026-03-17 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +5 | 陽陽哇塞 2026-03-14 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
[考研]
 271材料工程求調(diào)劑
+5
|
.6lL 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑 +3 | 墨墨漠 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿中國海洋大學(xué)，生物學(xué)，301分，求調(diào)劑 +4 | 1孫悟空 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)工程321分求調(diào)劑 +15 | 大米飯！ 2026-03-15 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +4 | ioodiiij 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 環(huán)境領(lǐng)域全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名 +3 | QGZDSYS 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 334求調(diào)劑 +3 | 志存高遠(yuǎn)意在機(jī)?/a> 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 277調(diào)劑 +5 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 梁成偉老師課題組歡迎你的加入 +8 | 一鴨鴨喲 2026-03-14 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿南京大學(xué)，080500材料科學(xué)與工程，調(diào)劑 +4 | Jy? 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 東南大學(xué)364求調(diào)劑 +5 | JasonYuiui 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | Yanyali 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703一志愿211 285分求調(diào)劑 +5 | ly3471z 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 中科院材料273求調(diào)劑 +4 | yzydy 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7 | 膩膩gk 2026-03-14 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5 | 指尖八千里 2026-03-14 | 5/250 |
|