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有沒(méi)有計(jì)算吸收光譜半峰寬的經(jīng)驗(yàn)公式 已有1人參與
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| 最近做了一下取代基效應(yīng)對(duì)共軛骨架吸收光譜的影響，文獻(xiàn)報(bào)道引入X可使吸收紅移，并且光譜展寬。我現(xiàn)在可以做出紅移，展寬高斯做不了好像，只能畫(huà)光譜的時(shí)候設(shè)定FWHM數(shù)值。我想請(qǐng)教一下，有沒(méi)有可以預(yù)測(cè)幫峰寬的經(jīng)驗(yàn)的或者簡(jiǎn)單實(shí)用的公式？萬(wàn)分感激�。� |
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3樓2014-10-15 08:32:26
ChemiAndy
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
mengsk: 金幣+2, ★★★很有幫助 2014-10-15 08:29:08
gmy1990: 金幣+5 2014-10-16 05:01:47
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gmy1990: 金幣+5 2014-10-16 05:01:47
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本質(zhì)上講，高斯的正則模式分析不能計(jì)算紅外峰寬，它得到的永遠(yuǎn)是譜線。為什么呢？因?yàn)樗挠?jì)算基于單個(gè)構(gòu)型（最優(yōu)構(gòu)象的基態(tài)ground state）， 而實(shí)際譜線變寬(broadening/diffusing)，是分子、原子相互作用、運(yùn)動(dòng)導(dǎo)致在不同構(gòu)型上吸收的結(jié)果，這從單個(gè)構(gòu)型計(jì)算是無(wú)法得到的。 譜線變寬有多種原因，多普勒效應(yīng)，雜質(zhì)效應(yīng)，量子效應(yīng)（不確定原理）， 壓力效應(yīng)。具體到你的體系，如果引入一個(gè)基團(tuán)，導(dǎo)致骨架某個(gè)模式的吸收變寬，很可能是這個(gè)基團(tuán)是吸電子的，弱化了骨架的共軛性能，破壞了骨架的剛性，而柔性的分子有更大的可能在熱作用之下呈現(xiàn)更多的構(gòu)型，從而使譜線變寬。由于峰帶的寬度與溫度、分子偶極變化有關(guān), 而且對(duì)環(huán)境以及測(cè)量參數(shù)極為敏感，因此不太可能有任何理論能夠預(yù)測(cè)這個(gè)寬度。（c.f. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21165017） 有一種方法能夠模擬特定溫度下的紅外光譜，就是分子動(dòng)力學(xué)方法，即系綜平均法。這種方法能夠得到峰帶band。這種方法通過(guò)對(duì)體系的總偶極的自相關(guān)函數(shù)的傅里葉變換得到吸收光譜，前提是你需要跑一個(gè)從頭算分子動(dòng)力學(xué)，還要計(jì)算每一步的總偶極，最后的傅里葉變換也需要特定的code，略微麻煩，感覺(jué)你犯不著去趟那趟渾水。 |
2樓2014-10-15 05:52:30
4樓2014-10-15 08:34:05
ChemiAndy
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5樓2014-10-15 12:12:02
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