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fentuo1203新蟲 (初入文壇)
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[交流]
關(guān)于MS中CASTEP表面優(yōu)化和MORPOLOGY模塊中無(wú)限長(zhǎng)鏈的問(wèn)題 已有1人參與
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各位好，我是MS的初級(jí)入門者，在使用過(guò)程中，由于知識(shí)不夠，經(jīng)驗(yàn)不足，碰到了很多問(wèn)題，其中比較困擾我，讓我無(wú)法前進(jìn)的有兩個(gè)問(wèn)題。 第一個(gè)是關(guān)于CASTEP表面優(yōu)化的問(wèn)題。我想用它來(lái)做一下晶體表面吸附，晶體是氯化物的離子晶體，是根據(jù)FINDIT的晶格參數(shù)來(lái)構(gòu)建的。切完面加了真空層之后進(jìn)行優(yōu)化，建立了2*2的超胞，如圖1所示，根據(jù)教程想做避免弛豫，就把下層原子固定了，為紅色部分。但是在優(yōu)化之后卻發(fā)現(xiàn)原子層相對(duì)于真空層的位置發(fā)生了變化，如圖2所示，這讓我比較困惑，按道理靠近真空層的表面是放松的，這樣小分子加在真空層中進(jìn)行吸附，但是這么大的變化，我不知道小分子該加在哪里了。 http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1413955060_823.jpg（圖1） http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1413955103_805.jpg（圖2） 第二個(gè)是關(guān)于MORPOLOGY模塊中無(wú)限長(zhǎng)鏈的問(wèn)題。文獻(xiàn)知道用該模塊可以模擬晶體的生長(zhǎng)形貌。用BFDH方法是不加力場(chǎng)，直接計(jì)算就可以了，但是用GROWTH和EQUILIBRIUM方法時(shí)，就會(huì)提示晶胞中有無(wú)限長(zhǎng)鏈結(jié)構(gòu)，無(wú)法進(jìn)行計(jì)算。查閱了小木蟲上面關(guān)于此方面的帖子，有些說(shuō)建立超晶胞，然后建立更大的盒子把它裝起來(lái)，不知道是怎么操作。我嘗試著用重建晶胞的方法，把a(bǔ)bc的值都增加，雖然在計(jì)算上沒(méi)有了無(wú)限長(zhǎng)鏈的提醒，但是卻沒(méi)有生長(zhǎng)的形貌圖。不知是做法錯(cuò)誤還是什么情況，請(qǐng)各位大神能夠不吝賜教。非常感謝！ NiCl2 cell 003).jpg NiCl2 cell 003)2.jpg |
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2樓2017-12-24 15:25:28
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