 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (5542)
- >考研 (2370)
- >導(dǎo)師招生 (2022)
- >文獻(xiàn)求助 (343)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (331)
- >碩博家園 (173)
- >休閑灌水 (158)
- >考博 (99)
- >招聘信息布告欄 (87)
- >基金申請(qǐng) (85)
- >博后之家 (66)
- >綠色求助(高懸賞) (43)
- >論文投稿 (40)
- >材料綜合 (24)
- >外文書(shū)籍求助 (16)
- >找工作 (15)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 4297 | 回復(fù): 12 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
[求助]
TopHat初學(xué)者 Could not find Bowtie 2 index files (genome.*.bt2) 已有1人參與
|
||
|
tophat -p 4 -G genes.gtf -o C1_R1_thout genome GSM794483_C1_R1_1.fq GSM794483_C1_R1_2.fq [2014-10-22 13:40:45] Beginning TopHat run (v2.0.13) ----------------------------------------------- [2014-10-22 13:40:45] Checking for Bowtie Bowtie version: 2.2.3.0 [2014-10-22 13:40:45] Checking for Bowtie index files (genome).. Error: Could not find Bowtie 2 index files (genome.*.bt2) |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
283分材料與化工求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
349求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
296材料專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
一志愿上海海洋大學(xué)083200食品學(xué)碩，求調(diào)劑，接受其他專業(yè)
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
材料340分調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
316求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
321求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
315求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
330分求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
化工調(diào)劑303分，過(guò)四級(jí)
已經(jīng)有9人回復(fù)
wawa_eva
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1
- 帖子: 2
- 在線: 13分鐘
- 蟲(chóng)號(hào): 3491309
- 注冊(cè): 2014-10-22
3樓2014-10-22 15:33:42
4樓2014-10-22 21:51:01
wizardfan
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- BioEPI: 18
- 應(yīng)助: 599 (博士)
- 貴賓: 1.818
- 金幣: 24632.2
- 散金: 197
- 紅花: 48
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2254
- 在線: 400.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1879241
- 注冊(cè): 2012-07-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
BioChen: 金幣+50, ★★★★★最佳答案, 謝謝幫助。我了個(gè)去，居然最后的原因是文件沒(méi)有拷貝完全，我把下載的index文件夾里面全部文件拷貝之后，沒(méi)有問(wèn)題了。 2014-10-23 14:03:26
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
BioChen: 金幣+50, ★★★★★最佳答案, 謝謝幫助。我了個(gè)去，居然最后的原因是文件沒(méi)有拷貝完全，我把下載的index文件夾里面全部文件拷貝之后，沒(méi)有問(wèn)題了。 2014-10-23 14:03:26
|
你下載了幾個(gè)bt2文件？名字是什么？ 根據(jù)manual The basename of the genome index to be searched. The basename is the name of any of the index files up to but not including the first period. Bowtie first looks in the current directory （第一看當(dāng)前目錄） for the index files, then looks in the indexes subdirectory （第二看bowtie所在目錄的indexes子目錄） under the directory where the currently-running bowtie executable is located, then looks in the directory specified in the BOWTIE_INDEXES (or BOWTIE2_INDEXES) environment variable（或者設(shè)置BOWTIE2_INDEXES環(huán)境變量）. Please note that it is highly recommended that a FASTA file with the sequence(s) the genome being indexed be present in the same directory with the Bowtie index files and having the name <genome_index_base>.fa. If not present, TopHat will automatically rebuild this FASTA file from the Bowtie index files. |
5樓2014-10-23 06:58:45
七叔118
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 10
- 帖子: 4
- 在線: 14.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1937584
- 注冊(cè): 2012-08-13
- 專業(yè): 畜牧學(xué)
6樓2015-05-12 09:00:23
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[基金申請(qǐng)]
請(qǐng)問(wèn)共同通訊和共同一作的認(rèn)可度問(wèn)題
 10+4
|
psa1234 2026-04-01 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿同濟(jì)大學(xué)323分（080500）求調(diào)劑 +6 | yikeniu 2026-04-01 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑！生物與醫(yī)藥專碩 +4 | 逆轉(zhuǎn)陸先生 2026-04-01 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856初試324分求調(diào)劑 +6 | 想上學(xué)求調(diào) 2026-04-01 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085600，材料與化工321分，求調(diào)劑 +13 | 大饞小子 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 一志愿安徽大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)碩，331分求調(diào)劑 +5 | 蔣昌鵬qtj 2026-04-01 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +11 | 一樣YWY 2026-03-31 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑 +10 | 哇呼哼呼哼 2026-04-01 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 266分求材料化工冶金礦業(yè)等專業(yè)的調(diào)劑 +7 | 哇呼哼呼哼 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +12 | 小熊～～ 2026-03-31 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 070300一志愿211，312分求調(diào)劑院校 +14 | 小黃鴨寶 2026-03-30 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +6 | akie... 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 282求調(diào)劑 不挑專業(yè) 求收留 +4 | Yam. 2026-03-30 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 +16 | kikiki7 2026-03-30 | 16/800 |
|
|
|
[考研]
 一志愿大連理工大學(xué)材料求調(diào)劑
+6
|
Gymno 2026-03-30 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑 +3 | 種圣賜 2026-03-29 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085600，專業(yè)課化工原理，321分求調(diào)劑 +5 | 大饞小子 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +11 | 陽(yáng)陽(yáng)哇塞 2026-03-27 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +3 | 李嘉圖·S·路 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉大071010，316分求調(diào)劑 +3 | xgbiknn 2026-03-27 | 3/150 |
|