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chenwc319木蟲 (正式寫手)
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[求助]
Possible racemic twin or wrong absolute struture-try TWIN refinement 已有1人參與
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晶體解析時(shí)候，遇到了這個(gè)問題：possible racemic twin or wrong absolute struture-try TWIN refinement。 該晶體是Hexagonal, P6(3)手性空間群。加了twin命令后，flack值就是0了，不對(duì)。要是不加這個(gè)twin這個(gè)命令， cif中提示Flack 值是0.355.而且check cif有C類錯(cuò)誤： Flack test results are ambiguous. From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack 0.355 From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su 0.011 這個(gè)問題應(yīng)該如何解決，要具體解決辦法以及原因。 如果不需要解決，需要解釋的話，請(qǐng)說明在cif中如何解釋。 謝謝。金幣不夠可以追加 |
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chenwc319: 金幣+100, ★★★很有幫助, 還需要繼續(xù)幫助 2014-10-24 14:17:16
TonyGeN: 金幣+2, 感謝熱情應(yīng)助 2014-10-26 18:51:13
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1. 非手性分子但確定為手性空間群，同樣要做Flack。注意此時(shí)的HKL數(shù)據(jù)應(yīng)該是沒有被平均過的。在shelx程序里面設(shè)置 MERG 3，或者重新評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)選擇不平均項(xiàng)。 2. 既非手性分子又不是手性空間群，checking程序是不會(huì)問這個(gè)問題的，不然就要再次檢查空間群是否正確了。 3.如果不是手性空間群，比如p-1等，那么可以直接刪除_refine_ls_abs_structure_Flack ，或者在其后加上‘?’ 造成上述警示的原因是簡(jiǎn)單的twin精修，如果在twin后面加上矩陣就可以解決，twin matrix就可以得到偏差。 比如 twin 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 BASF 0.5 flack 參數(shù)就會(huì)給出標(biāo)準(zhǔn)偏差。 |
2樓2014-10-22 19:39:02
chenwc319
木蟲 (正式寫手)
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3樓2014-10-22 19:52:43
4樓2014-10-22 20:32:54
chenwc319
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5樓2014-10-23 08:32:43
6樓2014-10-24 20:31:31
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