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小兵ai石頭銅蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
怎么從cif文件中提取所需要的分子的pdb文件?
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我需要初始的b-cyclodextrin的pdb文件,于是按照參考文獻(xiàn),在CCDC下載了BCD-12H2O.cif 文件。 然后用GaussView打開(kāi),另存為pdb,再用VMD將pdb打開(kāi),看到一些破碎的b-cyclodextrin片段,還有一些水分子。 所以我的問(wèn)題是,我該怎么得到b-cyclodextrin完整且單獨(dú)的(無(wú)水)的pdb文件?或者是需要什么軟件來(lái)做轉(zhuǎn)化? 這個(gè)貌似是做分子模擬的基礎(chǔ)問(wèn)題 ,但是很困擾我啊,希望大家不吝指導(dǎo)!O(∩_∩)O謝謝 |
銅蟲(chóng) (初入文壇)
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