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gn02530640銀蟲 (小有名氣)
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PyMol 手動(dòng)改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)后，是否可以保存其構(gòu)型? 已有1人參與
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如題，我目前想將一個(gè)蛋白質(zhì)單體的helix結(jié)構(gòu)改成sheet結(jié)構(gòu)，于是按照手冊(cè)輸入以下指令： show cartoon alter 1-17/, ss='S' # assign residues 1-17 as sheet alter 18-27/, ss='L' # assign residues 18-27 as loop alter 28-37/, ss='S' # assign residues 28-37 as sheet rebuild # regenerate the cartoon 結(jié)果是成功的，但是問(wèn)題在于我沒(méi)有辦法將改變后的結(jié)構(gòu)保留存成pdb文件(就是說(shuō)即使我存了pdb文件，但用VMD讀取后依舊是原來(lái)的helix結(jié)構(gòu)，而不是修改后的sheet結(jié)構(gòu))。 有無(wú)蟲友能夠解決這個(gè)問(wèn)題? 或是能夠教我如何用PyMol 或 Discovery Studio 建構(gòu)出 sheet 結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)? 感激不盡  |
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4樓2014-10-30 22:30:12
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5樓2014-10-30 23:10:25
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