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專業(yè): 電化學(xué)分析

[求助] pwscf做半導(dǎo)體晶胞結(jié)構(gòu)優(yōu)化

我建立的是半導(dǎo)體超晶胞模型，表面有一個團(tuán)簇模型吸附，想先做結(jié)構(gòu)優(yōu)化再進(jìn)行其他計(jì)算，in文件如下：
&CONTROL
calculation= "vc-relax",
restart_mode='from_scratch'
prefix= "cds",
pseudo_dir= "/vol6/home/zhang00/pseudo1",
outdir= "./",
tprnfor =.true,
nstep =50,
etot_conv_thr =1.0E-6,
forc_conv_thr =1.0D-5,
dt =50,
/
&SYSTEM
ibrav=0,celldm(1)=7.552000,nat=52,ntyp=4,
ecutwfc=40,ecutrho=400,
occupations ='smearing',
smearing ='mp',
degauss =0.025,
/
&ELECTRONS
conv_thr= 1.D-6,
mixing_beta= 0.7D0,
/
&IONS
/
&CELL
cell_dynamics ='bfgs'
/
ATOMIC_SPECIES
O  16.00  O.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF
S  32.00  S.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF
Ti 48.00  Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
Cd 112.40 Cd.pbe-n-van.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
O 0.000000 0.000000 0.000000
O 0.250000 0.250000 0.264805
。。。。。這里省略其它的
K_POINTS automatic
3 3 2 0 0 0
CELL_PARAMETERS
7.5520000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 7.5520000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 17.9113240
之后提交服務(wù)器任務(wù)，計(jì)算輸出結(jié)果如下：
Initial potential from superposition of free atoms
   Check: negative starting charge= -0.185650

   starting charge  403.99853, renormalised to  420.00000

   negative rho (up, down):  0.193E+00 0.000E+00
yhrun: error: cn2411: task 0: Killed
yhrun: First task exited 60s ago
yhrun: tasks 1-5: running
yhrun: task 0: exited abnormally
yhrun: Terminating job step 747818.0
slurmd[cn2411]: *** STEP 747818.0 KILLED AT 2014-11-04T17:03:06 WITH SIGNAL 9 ***
yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish.
slurmd[cn2411]: *** STEP 747818.0 KILLED AT 2014-11-04T17:03:06 WITH SIGNAL 9 ***

前面讀取信息都沒有問題啊，到這里開始進(jìn)行計(jì)算，任務(wù)直接就killed的，求高人幫看看是什么問題啊，贗勢文獻(xiàn)選擇？k-point設(shè)置？還是截?cái)嗄埽?還是其它值設(shè)定問題？
還有occupations這一項(xiàng)，我的是半導(dǎo)體，這個值該選擇什么呢？smearing不是針對金屬么？tetrahedra這個只說適合計(jì)算DOS��？做結(jié)構(gòu)優(yōu)化計(jì)算，對于原子間力，離子力，壓力這些都必須要進(jìn)行計(jì)算么？收斂值的選擇該怎么確定呢？

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1樓 2014-11-05 11:20:43

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