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旱地鯰魚(yú)金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
科研軟件使用問(wèn)題求助 已有1人參與
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各位大神： 小弟是autodock菜鳥(niǎo)，最近在使用autodock4.0.1研究藥物分子，以便探索新型結(jié)構(gòu)的小分子化合物，遇到了一些問(wèn)題，懇請(qǐng)各位好心人提供寶貴的意見(jiàn)和建議，不勝感激，問(wèn)題敘述如下： 1）大分子受體的優(yōu)化 如何在保留活性部位的情況下盡可能地精簡(jiǎn)化大分子以便縮短對(duì)接分析時(shí)間和提高準(zhǔn)確度，等等； 2）柔性殘基的選擇 如何選擇所需要的柔性殘基（選擇哪個(gè)，為什么，怎么選擇），是否可以不做柔性殘基對(duì)接，而只做剛性對(duì)接，等等； 3）對(duì)接結(jié)果的分析 如何利用對(duì)接數(shù)據(jù)評(píng)價(jià)對(duì)接結(jié)果，哪些數(shù)據(jù)可以說(shuō)明對(duì)接結(jié)果的好壞，如何說(shuō)明（數(shù)據(jù)越大越好還是越小越好），等等。 懇請(qǐng)各位autodock高手不吝賜教，最好有詳細(xì)周全的解答，有參考文獻(xiàn)和有關(guān)鏈接也行，再次臨表涕零，不勝感激！ |
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2樓2014-11-17 18:10:14
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