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[求助]
關(guān)于siesta的一些幼稚問題 已有1人參與
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我裝好了siesta2.0.2,也看得懂輸入文件的參數(shù)了。但是我不知道如何使用siesta。。。有夠淺顯的吧。 是在什么地方編寫輸入文件？輸入文件如何使用？……我不知道運(yùn)行siesta之后該怎么用〒_〒 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
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2樓2014-12-01 13:10:15
KalaShayminS
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 432 (碩士)
- 金幣: 6174.2
- 紅花: 56
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- 在線: 379小時
- 蟲號: 2408111
- 注冊: 2013-04-08
3樓2014-12-01 23:35:14
4樓2014-12-02 13:23:36
KalaShayminS
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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5樓2014-12-02 21:14:19
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zzy@ubuntu:~$ siesta</home/zzy/sourcecode/siesta-2.0.2/Examples/H2O/h2o.fdf Siesta Version: siesta-2.0.2 Architecture : x86_64-unknown-linux-gnu--unknown Compiler flags: /opt/mpich2/bin/mpif90 -g -O2 PARALLEL version * Running in serial mode with MPI >> Start of run: 14-DEC-2014 19:41:12 *********************** * WELCOME TO SIESTA * *********************** reinit: Reading from standard input ************************** Dump of input data file **************************** SystemName Water molecule SystemLabel h2o NumberOfAtoms 3 NumberOfSpecies 2 %block ChemicalSpeciesLabel 1 8 O # Species index, atomic number, species label 2 1 H %endblock ChemicalSpeciesLabel AtomicCoordinatesFormat Ang %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.000 0.000 0.000 1 0.757 0.586 0.000 2 -0.757 0.586 0.000 2 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies ************************** End of input data file ***************************** reinit: ----------------------------------------------------------------------- reinit: System Name: Water molecule reinit: ----------------------------------------------------------------------- reinit: System Label: h2o reinit: ----------------------------------------------------------------------- initatom: Reading input for the pseudopotentials and atomic orbitals ---------- Species number: 1 Label: O Atomic number: 8 Species number: 2 Label: H Atomic number: 1 Ground state valence configuration: 2s02 2p04 read_pseudo: ERROR: Pseudopotential file not found: O.psf Stopping Program from Node: 0 application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0 zzy@ubuntu:~$ 第一次見計(jì)算的時候出現(xiàn)了這些....醉了 |
6樓2014-12-14 19:46:58
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