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Lotus_ping新蟲 (小有名氣)
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[交流]
map QTL5結(jié)果求分析
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我用map QTL5給一個F1群體進行QTL定位，是分別以兩親本的圖譜作圖，一親本圖譜是高密度的（0.7CM），另一親本圖譜是低密度（6.6CM）,現(xiàn)在結(jié)果如下： 1.用區(qū)間作圖，高密度的LOD值都超低，超過2的都少；低密度的LOD值相對高些，但是貢獻率都好高 2.用1000次排布檢測，高密度圖譜確定的閾值都不高，2左右，但是低密度的閾值都較高，一般4到5，有的甚至到10了，正常嗎？ 3.以低密度圖譜IM檢測到的QTL最高點為輔助因子，進行MQM作圖，輔助因子處的LOD都降下來了……什么情況？ 低密度MQM作圖.jpg 低密度圖譜IM作圖.jpg 高密度圖譜IM作圖.jpg |
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