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[求助]
siesta2.0.2版本下計(jì)算自帶的fdf文件出現(xiàn)下面的這些東西，剛接觸，真心求指導(dǎo)！ 已有3人參與
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我是個(gè)新手，剛接觸的siesta，是想嘗試下他里面自帶例子的計(jì)算，于是有了下面這一些東西...輸入文件我倒是看得懂，不過(guò)輸出的那些東西好像是并行計(jì)算出錯(cuò)吧？真心想請(qǐng)教一下各位懂siesta的大神，先在此謝過(guò)了！ zzy@ubuntu:~$ siesta</home/zzy/sourcecode/siesta-2.0.2/Examples/H2O/h2o.fdf Siesta Version: siesta-2.0.2 Architecture : x86_64-unknown-linux-gnu--unknown Compiler flags: /opt/mpich2/bin/mpif90 -g -O2 PARALLEL version * Running in serial mode with MPI >> Start of run: 14-DEC-2014 19:41:12 *********************** * WELCOME TO SIESTA * *********************** reinit: Reading from standard input ************************** Dump of input data file **************************** SystemName Water molecule SystemLabel h2o NumberOfAtoms 3 NumberOfSpecies 2 %block ChemicalSpeciesLabel 1 8 O # Species index, atomic number, species label 2 1 H %endblock ChemicalSpeciesLabel AtomicCoordinatesFormat Ang %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.000 0.000 0.000 1 0.757 0.586 0.000 2 -0.757 0.586 0.000 2 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies ************************** End of input data file ***************************** reinit: ----------------------------------------------------------------------- reinit: System Name: Water molecule reinit: ----------------------------------------------------------------------- reinit: System Label: h2o reinit: ----------------------------------------------------------------------- initatom: Reading input for the pseudopotentials and atomic orbitals ---------- Species number: 1 Label: O Atomic number: 8 Species number: 2 Label: H Atomic number: 1 Ground state valence configuration: 2s02 2p04 read_pseudo: ERROR: Pseudopotential file not found: O.psf Stopping Program from Node: 0 application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0 zzy@ubuntu:~$ |
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