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dashuai1133新蟲 (小有名氣)
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[求助]
phonopy生成聲子譜的PRIMITIVE_AXIS和PRIMITIVE_AXIS設(shè)置 已有1人參與
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用phonopy將所有的vasprun.xml結(jié)果匯總得到力常數(shù)矩陣已做完，生成FORCE_SETS，看手冊上說運(yùn)行phonopy -f band.conf就能出結(jié)果。但對于band.conf的具體參數(shù)不太理解，不會(huì)設(shè)置。請各位老師指點(diǎn)：PRIMITIVE_AXIS=？ PRIMITIVE_AXIS=?  在線等結(jié)果。 |
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18樓2016-03-21 20:25:25
fyuewen
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原題引用“用phonopy將所有的vasprun.xml結(jié)果匯總得到力常數(shù)矩陣已做完，生成FORCE_SETS，看手冊上說運(yùn)行phonopy -f band.conf就能出結(jié)果。但對于band.conf的具體參數(shù)不太理解，不會(huì)設(shè)置。請各位老師指點(diǎn)：PRIMITIVE_AXIS=？ PRIMITIVE_AXIS=?” PRIMITIVE_AXIS的定義，其實(shí)在官網(wǎng)上的settings中已經(jīng)給出（雖然有一處作者有點(diǎn)筆誤）。而且樓上有一位其實(shí)已經(jīng)說的很清楚了。M_p是用來對unit cell轉(zhuǎn)化成 primitive cell用的。 具體定義為（a_p, b_p, c_p) = (a_u, b_u, c_u)*M_p 此處p代表primitive cell, u 代表unit cell. |
21樓2016-06-09 16:46:09
dashuai1133
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2樓2014-12-24 15:16:45
dashuai1133
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3樓2014-12-24 16:19:27
dx0620
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
ljw4010: 金幣+2, 謝謝交流！ 2014-12-25 20:02:09
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你可以把這一行去掉，因?yàn)橐话隳阌?jì)算的時(shí)候是不會(huì)選取原胞的，這個(gè)是原胞基矢的選項(xiàng)，所以不用加這一個(gè)參量。band.conf可以這樣寫： ATOM_NAME= DIM = 2 2 2 BAND = 0 0 0 0 0 0.5 -0.5 0 0.5 -0.5 0 0 -0.5 0.5 0 0 0.5 0 0 0.5 0.5 -0.5 0.5 0.5 BAND_POINTS = 101 BAND_LABELS = \Gamma Z T Y S X U R BAND確實(shí)可以選取跟castep一樣的，或者自己選點(diǎn)也行 |
4樓2014-12-25 09:21:31
5樓2014-12-25 15:39:18
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6樓2014-12-25 16:38:15
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