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[求助] 批量提交作業(yè) 已有1人參與

我有一系列的文件2k-1.pdb,2k-3.pdb.......,我需要用一個(gè)軟件對(duì)每個(gè)文件進(jìn)行運(yùn)算生成2k-1.out，2k-2.out.......，我想批量提交這些作業(yè)，但是我不知道怎么寫(xiě)腳本，希望大神賜教！

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1樓 2015-01-02 12:27:03

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What's script are you familiar with? Shell or cash or perk. There is command to read in a file. You can put all your pdb in one file and let the script read in whole file and process for you. Good luck.

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2樓2015-01-02 13:33:42

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2樓: Originally posted by zaq123321 at 2015-01-02 13:33:42
What's script are you familiar with? Shell or cash or perk. There is command to read in a file. You can put all your pdb in one file and let the script read in whole file and process for you. Good lu ...

我只懂一點(diǎn)shell，我寫(xiě)了一個(gè)shell腳本：
#！/bin/bash
for i in *.pdb
do
./shiftx 1X <${i}> ${i}.out
done
這樣1.pdb運(yùn)算后輸出的是1.pdb.out ,那個(gè)軟件不識(shí)別這種輸出文件名。怎么能讓它輸出1.out 的文件名？

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3樓2015-01-02 13:50:55

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【答案】應(yīng)助回帖

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菲同尋常: 金幣+5, ★★★很有幫助 2015-01-02 14:23:11

After do, define base='base name ${i}'
Change >$base.out

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4樓2015-01-02 14:01:02

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引用回帖:

4樓: Originally posted by zaq123321 at 2015-01-02 14:01:02
After do, define base='base name ${i}'
Change >$base.out

Basename

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5樓2015-01-02 14:02:23

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5樓: Originally posted by zaq123321 at 2015-01-02 14:02:23
Basename
...

謝謝，我知道了

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6樓2015-01-02 14:23:25

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${i%.pbs}也一樣，自動(dòng)從變量?jī)?nèi)容中摳掉最后的.pdb

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上善若水

7樓2015-01-05 09:37:37

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7樓: Originally posted by fmying at 2015-01-05 09:37:37
${i%.pbs}也一樣，自動(dòng)從變量?jī)?nèi)容中摳掉最后的.pdb

是${i%.pdb}

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上善若水

8樓2015-01-05 09:38:17

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