 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 861 | 回復(fù): 4 | |||
Cythera銅蟲 (初入文壇)
|
[求助]
gromacs 已有1人參與
|
| 安裝ubuntu系統(tǒng)自帶的gromacs 4.6.6-1，但是只是單機(jī)版的。如何繼續(xù)安裝并行版的gromacs？求大神指點(diǎn)！ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 gromacs |
» 猜你喜歡
277材料科學(xué)與工程080500求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
317求調(diào)劑
已經(jīng)有18人回復(fù)
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
280分求調(diào)劑 一志愿085802
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
0854電子信息求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
263求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
石河子大學(xué)（211、雙一流）碩博研究生長(zhǎng)期招生公告
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
北科281學(xué)碩材料求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
328求調(diào)劑，英語六級(jí)551，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有10人回復(fù)
wbf3ng
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 116 (高中生)
- 金幣: 2086.3
- 紅花: 8
- 帖子: 255
- 在線: 171.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 3202097
- 注冊(cè): 2014-05-13
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2015-01-17 13:07:40
Cythera
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 198
- 帖子: 16
- 在線: 10.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 3637764
- 注冊(cè): 2015-01-10
- 專業(yè): 分離過程
|
我的gromacs是4.6.6-1版本的，單機(jī)版的ubuntu軟件中心有，我直接安裝了�？墒遣⑿邪娴膅romacs要手動(dòng)編譯。我是按照下面的方法弄的。 下面將安裝并行版的Gromacs. （1）準(zhǔn)備工作 a.安裝gcc: sudo apt-get install gcc b.安裝g++: sudo apt-get install g++ c. 安裝gfortran: sudo apt-get install fort77。 d. 安裝lam-mpi: 下載：wget http://www.lam-mpi.org/download/files/lam-7.1.4.tar.bz2 解壓：tar xvjf lam-7.1.4.tar.bz2 安裝： cd lam-7.1.4 ./configure make make install 至此，安裝并行版Gromacs的準(zhǔn)備工作已完成。返回gromacs的解壓目錄： cd ../gromacs-xxx (2) 安裝并行版Gromacs make clean ./configure --enable-mpi --program-suffix=_mpi make mdrun （因?yàn)橹挥衜drun需要并行，所以，之需要make mdrun) sudo make install-mdrun. 我的安裝并行版Gromacs的準(zhǔn)備工作已完成。開始第（2）步之前，它說“要返回gromacs解壓目錄”，我不知道gromacs解壓在哪里，因?yàn)閱螜C(jī)版的gromacs是系統(tǒng)自己就有的。求大神指點(diǎn)，我剛接觸，所以一竅不通。。。 |
3樓2015-01-18 10:14:35
awaken2013
銅蟲 (小有名氣)
- 模擬EPI: 2
- 應(yīng)助: 26 (小學(xué)生)
- 金幣: 137.9
- 紅花: 15
- 帖子: 243
- 在線: 149.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 2854550
- 注冊(cè): 2013-12-07
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
4樓2015-01-20 00:24:37
Cythera
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 198
- 帖子: 16
- 在線: 10.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 3637764
- 注冊(cè): 2015-01-10
- 專業(yè): 分離過程
5樓2015-03-13 11:13:47
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 Cythera 的主題更新
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +3 | 濤濤Wjt 2026-03-22 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑 +6 | 上岸6666@ 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +11 | 冷笙123 2026-03-17 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南化學(xué)（0703）總分337求調(diào)劑 +9 | niko- 2026-03-19 | 10/500 |
|
|
[考研] 能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名 +5 | 脫穎而出 2026-03-16 | 17/850 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學(xué)化學(xué)070300，求調(diào)劑
+6
|
2117205181 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩301分求調(diào)劑 +7 | Liyouyumairs 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩333求調(diào)劑 +3 | 北道巷 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 勇敢的小吳 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)]
學(xué)校已經(jīng)提交到NSFC，還能修改嗎？
 40+4
|
babangida 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研]
 271材料工程求調(diào)劑
+8
|
.6lL 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿華南師大 070300（化學(xué)）304分求調(diào)劑 +3 | 0703武芊慧雪304 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，求調(diào)劑 +5 | 材化逐夢(mèng)人 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑 +8 | 小材化本科 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +16 | 于海海海海 2026-03-19 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑211或者雙一流 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085410人工智能專碩317求調(diào)劑（0854都可以） +4 | xbxudjdn 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩調(diào)劑 +5 | 204818@lcx 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[論文投稿] 有沒有大佬發(fā)小論文能帶我個(gè)二作 +3 | 增銳漏人 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 淇ya_~ 2026-03-17 | 5/250 |
|