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[求助] 如何將晶體數(shù)據(jù)導(dǎo)入gview，只顯示一個(gè)分子結(jié)構(gòu)，而不是晶胞圖。已有2人參與

我只想要一個(gè)分子結(jié)構(gòu)，而不是這種晶胞。

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1樓 2015-01-20 15:44:04

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

有一種方法，就是把晶體文件用chem3D打開，再保存成高斯輸入文件就會(huì)死一個(gè)單一的分子。不過(guò)得到的結(jié)構(gòu)不是特別完美，因?yàn)閹讉€(gè)軟件的兼容性沒(méi)那么無(wú)縫。但是，樓主可以試試。

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2樓2015-01-20 20:52:06

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丁小凡

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2樓: Originally posted by beibyangyang at 2015-01-20 20:52:06
有一種方法，就是把晶體文件用chem3D打開，再保存成高斯輸入文件就會(huì)死一個(gè)單一的分子。不過(guò)得到的結(jié)構(gòu)不是特別完美，因?yàn)閹讉€(gè)軟件的兼容性沒(méi)那么無(wú)縫。但是，樓主可以試試。

你好我以前沒(méi)有用過(guò)chem3D 按您說(shuō)的方法下載了chem3D ，但是怎么將晶體文件用chem3D 打開？謝謝啦

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搞科研

3樓2015-01-21 10:34:56

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tiechong

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

引用回帖:

3樓: Originally posted by 丁小凡 at 2015-01-21 10:34:56
你好我以前沒(méi)有用過(guò)chem3D 按您說(shuō)的方法下載了chem3D ，但是怎么將晶體文件用chem3D 打開？謝謝啦...

直接把晶體文件拖到軟件界面，或者可以打開，然后在下拉格式里找cif

其實(shí)最好害死保存成xyz，然后再用gaussview打開，兼容性會(huì)還寫

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4樓2015-01-21 11:00:04

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4樓: Originally posted by tiechong at 2015-01-21 11:00:04
直接把晶體文件拖到軟件界面，或者可以打開，然后在下拉格式里找cif

其實(shí)最好害死保存成xyz，然后再用gaussview打開，兼容性會(huì)還寫...

您好我按您的方法使用chem3D可以導(dǎo)入到Gaussview了但是不知道為什么剛開始放進(jìn)去還是正常有鍵的現(xiàn)在就只有原子沒(méi)有鍵了還有我的結(jié)構(gòu)測(cè)出來(lái)重影的一個(gè)地方有兩個(gè)挨著的原子怎么能讓他只有一個(gè)？謝謝您了

如何將晶體數(shù)據(jù)導(dǎo)入gview，只顯示一個(gè)分子結(jié)構(gòu)，而不是晶胞圖。-1

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如何將晶體數(shù)據(jù)導(dǎo)入gview，只顯示一個(gè)分子結(jié)構(gòu)，而不是晶胞圖。-2

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5樓2015-01-21 12:44:00

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丁小凡: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 謝謝 2015-01-22 10:04:17

引用回帖:

5樓: Originally posted by 丁小凡 at 2015-01-21 12:44:00
您好我按您的方法使用chem3D可以導(dǎo)入到Gaussview了但是不知道為什么剛開始放進(jìn)去還是正常有鍵的現(xiàn)在就只有原子沒(méi)有鍵了還有我的結(jié)構(gòu)測(cè)出來(lái)重影的一個(gè)地方有兩個(gè)挨著的原子怎么能讓他只有一個(gè)？謝謝您了
...

你這個(gè)明顯是晶體結(jié)構(gòu)里很多原子振蕩幅度很大, 解晶體的人不確定原子位置,用了幾個(gè)可能位置, cif文件里只有一個(gè)是最可能的位置, 你必須去cif文件里把標(biāo)記疊影原子刪除, 這類原子的標(biāo)記是不一樣的

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6樓2015-01-21 15:45:33

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丁小凡: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 謝謝 2015-01-22 10:04:36

引用回帖:

右鍵，打開方式》》打開了，分子亂糟糟的。沒(méi)關(guān)系，保存成高斯輸入文件就可以了。再用GV打開�？赡苓€是比較亂，這就需要你自己調(diào)試了，再進(jìn)行優(yōu)化。前邊我也說(shuō)過(guò)，兼容性不是特別好。但是我的不少體系是按這個(gè)方法做的。節(jié)省了不少的用GV畫分子時(shí)間。

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7樓2015-01-21 16:56:29

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6樓: Originally posted by tiechong at 2015-01-21 15:45:33
你這個(gè)明顯是晶體結(jié)構(gòu)里很多原子振蕩幅度很大, 解晶體的人不確定原子位置,用了幾個(gè)可能位置, cif文件里只有一個(gè)是最可能的位置, 你必須去cif文件里把標(biāo)記疊影原子刪除, 這類原子的標(biāo)記是不一樣的...

您好，我是初學(xué)者，也沒(méi)有人帶，我不知道怎么去cif文件里刪除重影原子，您可以教我一下嗎？

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搞科研

8樓2015-01-22 10:02:10

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